三個月前R 4.0版本就已經正式上線了，之前怕麻煩就一直沒更新，而現在由于要用到新版本的R包，才想起順便一起更新了R。 目前在官網上的最新版R是2020-06-22的4.0....
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更新R和R包
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用clusterProfiler做GSEA（一）GSEA的介紹：https://www.omicsclass.com/article/230GSEA有相應的軟件，其實clusterProfiler除了做go term 富集...
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「代碼記錄」WGCNA篇Nov 21, 2019更新 => 修正部分function代碼，實現了導出gene2module 目的 最近有個項目又準備跑WGCNA，之前跑通過一個，然后很久沒碰，...
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單細胞Seurat包升級之2,700 PBMCs分析（下）劉小澤寫于19.8.19主要介紹官方教程PBMC 3K的下游分析（https://satijalab.org/seurat/v3.0/pbmc3k_tutorial.html...
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10X單細胞測序分析軟件:Cell ranger單細胞測序有著漫長的過去，卻只有短暫的歷史---誰說的！ 說她漫長是因為到如今也有十幾年的歷史了，說她段短暫是因為針對單細胞的分析工具越來越有意義開發周期卻越來越短。一般生物...
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單細胞綜述之整合分析文章發表于nature review genetics：Integrative single- cell analysis，作者是Tim Stuart與Rahul Satij...
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2018-08-29用R分析蛋白質組學數據（1）：數據獲取和清洗R在RNAseq和基因組關注的比較多，在蛋白質組研究中雖然用的多，但是專門的博客和文章比較少，轉載一個蛋白質組學數據分析的文章。原文見https://datasciencep...
