好多同學詢問孟德爾隨機化的問題，我再來嘗試著梳理一遍，希望對大家有所幫助，首先看下圖1分鐘，盯著看將下圖印在腦海中： [圖片上傳失敗...(image-9bf17c-1668...
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R數據分析：孟德爾隨機化實操
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除了GWAS Catalog，還可以用CAUSALdb數據庫做GWAS要查詢以往的 GWAS 研究結果，可以使用 GWAS Catalog。GWAS Catalog 包含的信息非常多，不過有時可能滿足不了需要。介紹一個叫 CAUSALdb 的數...
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R數據分析：工具變量回歸與孟德爾隨機化，實例解析
原諒我又拖更好久，沒辦法，欸，就是懶，但是所有的單子都是保質保量完成的哈。，今天給大家寫工具變量和孟德爾隨機化，文章略微有些長，請大家準備好清醒的頭腦，和半個小時的閱讀時間哈...
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孟德爾隨機化(Mendelian Randomization) 統計功效（power）和樣本量計算1 統計功效（power）概念 統計功效（power）指的是在原假設為假的情況下，接受備擇假設的概率。 用通俗的話說就是，P<0.05時，結果顯著（接受備擇假設）; 在此結論...
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TwoSampleMR：兩樣本孟德爾隨機化孟德爾隨機化推斷暴露因素與健康結局的因果關系[http://www.lxweimin.com/p/8ac31267d3d8] 主要步驟：1. 讀取暴露因素GWAS數據選取合適...
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參考文獻排版，這幾點非常重要！之前和大家多次聊過參考文獻的排版。?? Zotero | 有了Zotero，參考文獻排版不再煩惱！ 定制版GB/T 7714來了，究竟有多好用？| Zotero 今天繼續介紹...
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熱圖 | 轉錄組樣品表達量相關系數矩陣寫在前面 很多時候，我們做完轉錄組，會想著看看樣品與樣品之間的表達相關性如何？依此，可以看看是否存在異常樣品，也或許可以找到一些生物學相關問題。常常，我會使用 R 語言的 C...
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基于R語言繪制Network幾種方式平時對于網絡圖的繪制，一般我們都會在R中生成邊和點列表后導入到Cytoscape和Gephi等的本地工具軟件當中，而R語言中也自帶有不少優秀的包也可精美的可視化我們的數據，所...
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GOplot | 更美觀的富集分析可視化GOplot | 更美觀的富集分析可視化 數據準備 GOplot使用了zscore概念，但其并不是指Z-score標準化，而是指每個GO term下上調(logFC>0)基因...
