此流程比之前的cellranger pipeline相對復(fù)雜一些。Cellranger multi可以同時運行轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)和免疫組庫數(shù)據(jù)。歡迎討論。 使用cellranger ...
關(guān)于10X 公司3‘和5’基因表達(dá)文庫的差異,官方給出的解釋如下: 這兩者很相似,但在最終的文庫中,捕獲的是不同的多聚腺苷酸化轉(zhuǎn)錄本末端。兩種方案都使用了polydT引物用于...
2020.11.19 Cell Ranger更新到了5.0版本。官網(wǎng)的更新說明包括以下三個部分: 一、關(guān)于基因表達(dá)和Feature Barcode分析的更新 ?Cell Ra...
運行clono_seurat<- subset(clono_seurat,cells = rownames(bcr))這一行,出現(xiàn)下列報錯:
Error in CellsByIdentities(object = object, cells = cells) :
Cannot find cells provided
不知道是什么原因?
單細(xì)胞免疫組庫數(shù)據(jù)分析||Seurat整合單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組與VDJ數(shù)據(jù)在做10X單細(xì)胞免疫組庫分析的是往往是做一部分BCR、TCR做一部分5‘轉(zhuǎn)錄組,那么怎樣才能把兩者結(jié)合到一起呢? 今天我們嘗試用我們的趁手工具做一下整合分析。 首先是下載數(shù)據(jù)...