R包文檔參考：https://www.metaboanalyst.ca/docs/RTutorial.xhtml#Workflow:%20Case%20Study%201[h...
IP屬地：廣西
-
MetaboAnalystR包靈活、可重復的分析代謝組數據 -
R包MetaboAnalystR安裝指南（Linux環境非root）前言 這是代謝組學數據分析的一個R包，包括用于代謝組學數據分析、可視化和功能注釋等眾多功能。最近有同事在集群中搭建蛋白和代謝流程，安裝這個包出現了問題，于是我折騰了一上午。 ...
-
批量壓縮文件
macos 打開終端pwd 查看當前目錄cd 路徑 設置要壓縮的文件夾所在的位置采用for 循環如我的example文件下有大量fastq文件，可設置 注意子目錄后綴進行更改
-
RStudio - 保存環境
http://www.lxweimin.com/p/9ada0b34e376?ivk_sa=1024320u[http://www.lxweimin.com/p/9ada0b...
-
關于ANCOMBC
https://bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/ANCOMBC/inst/doc/ANCOM.html[ht...
-
關于MaAsLin2
1.Adjust alpha diversity using covariates as fixed effect in Maaslin2## https://forum.b...
-
更多教程請關注“生信學習者”
-
大型文件的查看（tsv）
macbook可以采用“終端” 命令行工具: 在命令行中使用類似于less（在Linux和macOS上）或more命令來查看文件內容。這些工具不會將整個文件加載到內存中，因此...
-
臨床預測模型 第4章PSM: 平衡和矯正混雜因素 慎重選擇：可能會造成選擇性偏倚。因為匹配后，貧血組和非貧血組都刪掉部分人。那些刪掉的人可能就是有心血管事件的人。比較靠譜的方法是：想在原始數據上...
-
數據分析：微生物數據分析方法講解拆解地址 14 種差異分析方法步驟以及原理初解[https://xbiomeanalysis.github.io/XMAS_tutorial/principals-of-di...
-
用R完成傾向性得分匹配傾向性得分匹配是一類基于反事實理論的數據預處理方法，在醫學和政策研究中被廣泛應用。R中有幾個很優秀的包可用于開展傾向性得分匹配，而其中功能較強、知名較廣、使用方便的當屬Mat...
-
傾向性評分匹配完整實例（R實現）傾向性評分匹配（propensity score matching, PSM）主要是在隨機對照試驗(Randomized controlled trials,RCT)中用于衡...
-
psModel <- glm(formula = swang1 ~ age + sex + race + edu + income + ninsclas +
cat1 + das2d3pc + dnr1 + ca + surv2md1 + aps1 + scoma1 +
wtkilo1 + temp1 + meanbp1 + resp1 + hrt1 + pafi1 +
paco21 + ph1 + wblc1 + hema1 + sod1 + pot1 + crea1 +
bili1 + alb1 + resp + card + neuro + gastr + renal +
meta + hema + seps + trauma + ortho + cardiohx + chfhx +
dementhx + psychhx + chrpulhx + renalhx + liverhx + gibledhx +
malighx + immunhx + transhx + amihx,
family = binomial(link = "logit"),
data = rhc)
運行這段時，總是提示y應該介于0到1之間。這是怎么回事？ -
基于LEfSe分析進行微生物物種差異及關聯分析????LEfSe（LDA Effect Size）分析是一種用于發現和解釋高維度數據生物標識（基因、通路和分類單元等）的分析工具。在微生物分析過程中，這種分析方法主要采用線...
-
Less is more. <br>公眾號：折耳根說
-
用R實現傾向性評分匹配
幾日前，一腫瘤醫生回顧性收集了本院2008-2018年某主任主治的某癌所有病例資料，欲驗證A方法和B方法對該種腫瘤病人生存時間的差異。嘗試匹配無果，遂來咨詢。今天就和大家一同...
-
PCA(principal component analysis,主成分分析)1. 簡介 PCA(Principal Components Analysis)即主成分分析，也稱主分量分析或主成分回歸分析法，是一種無監督的數據降維方法。首先利用線性變換，...
-
【代謝組學】3.數據分析非靶向代謝組實驗設計 1.代謝物提取，一般要求每組至少10個樣；2.在所有提取好的樣本中取等量混合作為QC；3.QC樣本與實驗樣本穿插上機，開始十個QC，結尾三個QC，中間每...
-
CPDA注冊數據分析師、微軟Excel認證專家
