CIBERSORT的注意事項 CIBERSORT的使用，我們舉了幾個例子，但是還有一些疑問，只要有疑問在，就感覺心里不踏實。比如：1.CIBERSORT需要什么樣的數據？是芯...
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量化免疫浸潤時CIBERSORT的注意事項 -
生信地基系列--Sam/bam文件格式對于sam文件格式，已經有很多人寫過相應的中文介紹文章，但是基本上都是簡單粗暴的講了一下每個字符代表什么，但是如果真去研究的話有時候還是感覺有點這些寫的還是讓人懵逼，比如不知...
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GDAS002-Bioconductor備忘錄
title: GDAS002-Bioconductor備忘錄date: 2019-09-02 12:0:00type: "tags"tags: Bioconductorcat...
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非負矩陣分解（NMF）應用于scRNAseq的細胞分群NMF算法簡介 非負矩陣分解(Non-negative Matrix Factorization, NMF)的思想可以描述為，對于任意給定的一個非負矩陣V，NMF算法能夠找到...
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單細胞量化代謝活性-scMetabolism一、scMetabolism的安裝 scMetabolism是一個R包，用于在單細胞分辨率下量化代謝活性，目前只適用于物種是人的單細胞數據。作者推薦使用seurat的數據進行...
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第7篇：用Y叔的ChIPseeker對peaks進行注釋和可視化上一步驟（第6篇：重復樣本的處理——IDR）用IDR對重復樣本peaks的一致性進行了評估，同時得到了merge后的一致性的peaks——sample-idr，接下來就是對p...
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免疫學筆記-1 | T細胞分化發育及其Marker1 關鍵細胞類型或Marker縮寫： 骨髓多能造血干細胞 HSC 淋巴樣祖細胞 lymphoid progenitor cell T細胞抗原識別受體 TCR 抗原提呈細胞 A...
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Ubuntu Server安裝R和Rstudio
R是一個在科研領域很常用的工具，經常用R的年輕人或者經常上統計之都的肯定知道Rstudio的存在。然而對于R和Rstudio來講，還是有很多問題存在的，今天我就結合我上一次在...
