0.寫在前面 從我學(xué)生信開始，畫熱圖用的就是pheatmap，有時復(fù)雜化的需求會用到ComplexHeatmap。作為R語言畫圖的絕對霸主，ggplot2的熱圖卻無法在熱圖的...
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披著ggplot皮的pheatmap,深夜激動更新我的包 -
Seurat3.0對象及其操作列表seurat V3.0 命令列表https://satijalab.org/seurat/essential_commands.html[https://satijalab....
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SingleR || 單細胞細胞類型定義工具注：本教程的SingleR是老版本的(1.0.0)，由于SingleR在Revised: December 18th, 2019已經(jīng)升級到SingleR 1.0.5，新版本的...
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如何用轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)定量腫瘤浸潤免疫細胞有哪些方法可以用于評判腫瘤免疫浸潤 方法很多，這里先選個簡單一點MCPcounter，GEO和TCGA數(shù)據(jù)都可以分析，更重要的是因為包治百病=. = MCPcounter 加...
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Official release of Seurat 3.0的學(xué)習(xí)過程2018年8月份的時候，我也使用過seurat來分析單細胞測序數(shù)據(jù)，然后最近也需要使用seurat包來分析實驗室的單細胞測序數(shù)據(jù)，在R中安裝完seurat的包后，我到網(wǎng)站上下...
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龍星計劃第二天-關(guān)于alignment工具劉小澤寫于19.7.30來北大的龍星計劃做助教，接觸了一些之前沒有了解過的一些知識，簡單做下記錄，我個人其實是沒有這方面需求的因為課程都是配置在華為云上的，所以使用的數(shù)據(jù)也都...
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SRA 數(shù)據(jù)下載自救指南還在羨慕海峽那邊的朋友下載SRA 快到飛起？還在難過用wget 下載數(shù)據(jù)經(jīng)常下載不完整？用了官方的下載工具還是慢的不行？這里有一個SRA 下載自救嘗試指南供你參考。 需要用到...
