發簡信
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群體進化分析--基因流及群體歷史分析——我愿稱之為史上最全基因流（也稱基因遷移）是指從一個物種的一個種群向另一個種群引入新的遺傳物質，從而改變群體“基因庫”的組成。通過基因交流向群體中引入新的等位基因，...
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2025-05-02 | GWAS分析-包含LD信息的Locuszoom圖的繪制在進行GWAS分析之后呢，我們通常會通過LD clumpping得到lead SNP，然而這些lead SNP在基因組中會與其他SNP有比較強烈...
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文獻分享 | Nat Genet：常見 SNP 可以解釋人類身高的大部分遺傳因素●英文題目：《Common SNPs explain a large proportion of the heritability for hu...
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組會論文 | Nat Genet：大規模多性狀全基因組關聯分析鑒定數百個青光眼風險位點《Large-scale multitrait genome-wide association analyses identify hundre...
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2024-11-30 | 群體遺傳變異——SNP及INDEL calling進行群體遺傳學分析的前提是我們得得到變異信息，之前已經介紹了如何進行CNV的識別，那么本文來介紹下如何識別基因組中分布更多、更常見的變異SNP（...
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2024-11-14 | LDSC——分區遺傳力及組織細胞富集LDSC不僅僅可以用于計算以及檢驗GWAS結果的inflation是否是因為混雜因素（confounding）的影響，還可以有S-LDSC（pa...
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2024-11-10 | LDSC (LD score regression)一、什么是LDSC？ image.png LDSC，LD分數回歸，2015年由 Brendan K Bulik-Sullivan 提出的方法，旨...
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2024-11-09 | 孟德爾隨機化分析一、孟德爾隨機化（Mendelian Randomization， MR）的原理 隨機對照實驗（RCT）一般被認為是明確因果關系的金標準。其要求...
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2024-10-16 | GWAS數據SNP rsID的注釋
當我們拿到某個研究的GWAS summary data時，因為大多是二代測序的緣故，它的SNP ID可能不是正常的rsid，但是，我們下游有些分...