相信很多專題應該已經(jīng)講過SCENIC的使用,這兒,針對我自己對SCENIC的學習使用,遇到的問題做一個詳細的講解說明,希望能對大家理解學習應用SCENIC起到一些幫助。 SC...

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文章來源:scenic: single-cell regulatory network inference and clustering github 一、軟件安裝 安裝教程...
一、ScaleData()簡介 單細胞基因表達counts矩陣數(shù)據(jù)經(jīng)過NormalizeData()歸一化處理后,還需要進行scale標準化。ScaleData()[http...
最近對中性粒細胞感興趣,就多讀了幾篇文章。分享的這一篇是20年的cell。 HighlightsNeutrophils have variable lifetimes in ...
今年剛發(fā)在Advanced Science上的文章,影響因子16.806。 1. Mononuclear Phagocyte Atlas at Single-Cell Res...
我也發(fā)現(xiàn)了這個問題,給你點贊
Seurat::DoHeatmap 的謎之報錯Seurat::DoHeatmap 的謎之報錯 最近在學習Seurat教程(Seurat版本3.0.2),發(fā)現(xiàn)運行到倒數(shù)第二步做熱圖展示marker genes時總是報錯 主...
Seurat::DoHeatmap 的謎之報錯 最近在學習Seurat教程(Seurat版本3.0.2),發(fā)現(xiàn)運行到倒數(shù)第二步做熱圖展示marker genes時總是報錯 主...
大多數(shù)人應該不是中科院預警就行,部分期刊可能是吉大一院預警。 bmc cancer, Cancer Medicine, Frontiers in Genetics, INTE...
那你說個屁
不做生信、不做meta,零科研經(jīng)費就能輕松發(fā)6.6分SCI臨床醫(yī)生發(fā)SCI的方法有很多種,有科研經(jīng)費的可以做實驗,沒有科研經(jīng)費的可以做純生信數(shù)據(jù)挖掘、meta分析、病例報告等等。現(xiàn)在還有一種不用任何科研經(jīng)費就可以發(fā)SCI的方法,那就...
1. clusterProfiler包,bitr()轉換ID函數(shù) clusterProfiler 是Y叔寫的一個功能強大的R包,可以用來做各種富集分析,如GO、KEGG、DO...
單臂研究(single arm study):即單組臨床試驗,顧名思義,就是僅有一個組的研究,沒有為試驗組設計相對應的對照。部分文章取名為病例系列研究(case series...
CRISPR 首先來介紹一些CRISPR,它首先在大腸桿菌中發(fā)現(xiàn),全稱為:Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic ...
??最近一直在學習單細胞方面的知識,無意中看到別人的帖子在分享如何畫堆疊的小提琴圖(StackedVlnPlot),順便就學習了一下。發(fā)現(xiàn)StackedVlnPlot圖確實看...
為什么我的rds@meta.data$stim是NULL呢
單細胞亞群鑒定知多少(二)作者:堯小飛審稿:童蒙編輯:angelica 引言 上一期我們詳細介紹了幾種細胞marker基因的獲取方法,為細胞亞群鑒定打好了堅實的基礎。在這里我們接著看如何進行單細胞亞群...