最近有小伙伴私信我，如下的單細胞UMAP圖怎么做？是啥樣的圖呢？就是UMAP圖上其他群是灰色的，只有某個群或者某幾個群是標記顏色的，比較突出。其實很簡單，一種辦法可參考我們之...
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單細胞UMAP圖只標記特定細胞群、圈定細胞群及坐標軸修改
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滿足你的碩士畢業論文小套路---蛋白結構與功能和疾病關系的生信分析完整套路
目前，許多學校的碩士畢業論文要求都是發表一篇中文核心論文，便能達到畢業小論文考核。針對小論文的發表，有的同學要么是因為課題難度有些大，沒有摸好合適的濃度，實驗結果不理想。...
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單細胞測序（sc-RNA seq）分析：Seurat4.0系列教程、高級分析、文章復現
時代的洪流奔涌而至，單細胞技術也從舊時王謝堂前燕，飛入尋常百姓家。雪崩的時候，沒有一片雪花是無辜的，你我也從素不相識，到被一起卷入單細胞天地。R語言和Seurat已以勢如破竹...
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單細胞數據中到底應該如何處理線粒體基因
什么是線粒體基因 線粒體是參與細胞凋亡啟動和執行的主要細胞器之一。線粒體基因在大多數細胞中表達，其表達水平是細胞類型特異性的。也就是說這個也是和細胞類型及其狀態有關系的。 為...
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轉錄組學習七（差異基因分析）
轉錄組學習一（軟件安裝） 轉錄組學習二（數據下載） 轉錄組學習三（數據質控） 轉錄組學習四（參考基因組及gtf注釋探究） 轉錄組學習五（reads的比對與samtoo...
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1.轉錄組 | 上游分析（數據下載，比對，計數）參考：轉錄組分析記錄； 轉錄組入門和進階以下內容為轉錄組全部的上游分析，包括下載數據、比對、計數得到表達矩陣。https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo...
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轉錄組RNA-SEQ上游分析2020安裝配置conda 使用清華源下載sh腳本并安裝 下載完成后直接運行腳本文件bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh。需要輸入yes然后等...
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RNAseq007 轉錄組入門上游分析全流程
傳送門： RNAseq006 轉錄組入門(6)：reads計數RNAseq005 轉錄組入門(5)：序列比對RNAseq004 轉錄組入門(4)：參考基因組下載RNAseq0...
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RNA-seq 數據分析最佳實戰（綜述）知識的學習沒有一蹴而就，沒有捷近，扎實的學習是唯一的捷近。 一篇RNA-seq分析流程的綜述，全面而詳細！深度好文，可用來反復閱讀。初學者用于把握RNA-seq真個流程及各個...
