發(fā)簡信
IP屬地：云南
-
熱點(diǎn)綜述 | ChatGPT和大型語言模型在生物醫(yī)藥和健康領(lǐng)域的機(jī)遇與挑戰(zhàn)ChatGPT 憑借其出色的文本生成能力引起了公眾和領(lǐng)域?qū)＜业臉O大關(guān)注。2024年1月，《Briefings in Bioinformatics...
-
時(shí)空組工具 | SpaTrack：通過最優(yōu)傳輸分析推斷空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)的細(xì)胞軌跡細(xì)胞時(shí)空分化軌跡是指在個(gè)體發(fā)育過程中，細(xì)胞在不同時(shí)間和空間條件下的分化過程。細(xì)胞分化的軌跡推斷，能夠?yàn)檠芯拷M織發(fā)育、疾病進(jìn)展提供重要見解。由于細(xì)...
-
NC | DPM：多組學(xué)數(shù)據(jù)的定向整合與通路富集分析多組學(xué)技術(shù)可生成細(xì)胞和組織中生物大分子的綜合圖譜。然而，要全面了解底層系統(tǒng)，需要對多種數(shù)據(jù)模式進(jìn)行聯(lián)合分析。2024年7月，《Nature Co...
-
COMMUN BIOL | Chrysalis：利用原型分析解碼空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)中的組織區(qū)室由于空間分辨率有限且依賴單細(xì)胞參考數(shù)據(jù)，在空間轉(zhuǎn)錄組學(xué) (ST) 中解析組織區(qū)室仍然具有挑戰(zhàn)性。2024年11月，《Communications...
-
物種鑒定筆記 | Taxometer：改進(jìn)宏基因組contigs的分類對于基于分類學(xué)的宏基因組組裝contigs分類，當(dāng)前方法使用序列相似性來確定其最可能的分類學(xué)。然而，在宏基因組分類的相關(guān)領(lǐng)域中，contigs通...
-
NC| multiDGD：適用于多組學(xué)數(shù)據(jù)的多功能深度生成模型現(xiàn)有的多模態(tài)數(shù)據(jù)模型通常在功能或可擴(kuò)展性方面受到限制，使得數(shù)據(jù)集成和下游分析變得繁瑣。2024年11月，《Nature Communicatio...
-
物種鑒定筆記 | 數(shù)據(jù)庫選擇和置信度得分對Kraken2分類性能的影響Kraken2適用于大規(guī)模宏基因組分析，其性能受到參考數(shù)據(jù)庫選擇和置信度參數(shù)設(shè)定的直接影響。2024年7月，《aBIOTECH》發(fā)表研究論文，系...
-
Nat Methods | CelloType：用于組織圖像分割和分類的統(tǒng)一模型細(xì)胞分割和分類是空間組學(xué)數(shù)據(jù)分析中的關(guān)鍵任務(wù)。2024年11月，《Nature Methods》發(fā)表了一種端到端的模型——CelloType，專...
-
物種鑒定筆記 | EUKARYOME：用于鑒定所有真核生物的 rRNA 基因參考數(shù)據(jù)庫基于核標(biāo)記的微生物和大生物分子鑒定徹底改變了我們對它們的分類學(xué)、系統(tǒng)發(fā)育和生態(tài)學(xué)的理解。如今，對全球生態(tài)系統(tǒng)中真核生物多樣性的研究嚴(yán)重依賴于核核...