寫在前面 當完成了對scRNAseq數據的Normalization和混雜因素去除后，我們就可以開始正式分析了。??本期我們介紹一下常用的聚類方法(clustering)，主要...
發簡信
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?? scRNA-seq | 吐血整理的單細胞入門教程（共識聚類）（十二） -
[富集分析] 5、Gene Ontology(GO)、Disease Ontology(DO)相似度分析
參考自：https://yulab-smu.top/biomedical-knowledge-mining-book/semantic-similarity-overview...
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熱圖6：系列終章之“奇形怪狀”的熱圖走到這里，也代表熱圖這個系列到最終篇了。最后我們說說一些奇形怪狀的熱圖。其實小編也發現，生物學現在整的不太好的一個方面就是發論文大家太注重圖了，反倒忽略了數據的價值。我是認為...
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升級 Rstudio Server，解決網頁版Rstudio不能同時出圖的bugRstudio-非常強大的IDE Rstudio是專注于R統計語言編程環境的IDE，基本取代了原生的操作界面而成為目前使用范圍最廣泛、功能最強大的編程軟件。我們在可視化操作...
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clusterProfiler 4.0開箱即用Y叔的clusterProfiler 升級到4版本了，所以試用一下它的內容，其實文章都有寫，我就是簡單copy一下文章中的代碼。 如果直接安裝安裝不了的話，就使用本地安裝吧 ...
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Q&A | 如何使用clusterProfiler對MSigDB數據庫進行富集分析Q&A | 如何使用clusterProfiler對MSigDB數據庫進行富集分析 [TOC] Question 有朋友在后臺提問：在使用clusterProfiler做富集...
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GO富集分析-對比Gorilla, clusterProfiler, topGO三種工具part1實在懶得找meme了 GOrilla, clusterProfiler, topGO 分析 ranked gene list (GSEA) 對比 Genelist prepa...
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MOVICS系列教程(一) GET Module
前言 Immugent在之前的推文：整合多組學數據進行分型之MOVICS[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI4MjY5ODI1Nw==&...
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那么多的基因，我只想要mRNA和lncRNA（或者miRNA）怎么辦？之前我在簡書上寫了一篇"如何只下載TCGA腫瘤或正常標本的count[http://www.lxweimin.com/p/ebbd22a36d3b]"的教程，原以為沒什么人看...
