最近實在太忙了，好久沒有更新我們的簡書了，今天抽空無論如何也要更新。 示例：查詢PDCD1在各個泛癌細胞系中表達情況。 首先我們打開我們的CCLE數(shù)據(jù)庫上網(wǎng)頁，網(wǎng)址走起，如果...
發(fā)簡信
IP屬地：浙江
-
CCLE查詢基因在細胞系中表達 -
單基因TCGA的Cox森林圖怎么畫才好看首先調(diào)取Xena網(wǎng)頁的TCGA數(shù)據(jù)做Cox生存分析，數(shù)據(jù)可以通過hiplot官網(wǎng)自主研發(fā)的ucsc-xena-shiny直接在線獲取訪問https://hiplot.com....
-
-
HPA數(shù)據(jù)庫概要（Human Protein Atlas）HPA數(shù)據(jù)庫（Human Protein Atlas）是基于蛋白組學,轉(zhuǎn)錄組學以及系統(tǒng)生物學數(shù)據(jù)，可以繪制組織、細胞、器官等圖譜。不僅收錄了腫瘤組織，也涵蓋了正常組織的蛋白表...
-
示例：利用HPA數(shù)據(jù)庫搜索血液中不同免疫細胞PD1表達情況PD-1（程序性死亡分子1），有PDCD1基因編碼，是一種重要的免疫抑制分子。之前我們對HPA數(shù)據(jù)庫進行的簡介，這里我們將利用HPA數(shù)據(jù)庫示例，搜索血液中不同免疫細胞PD1基...
-
DAVID數(shù)據(jù)庫簡介及使用說明很高興今天給大家介紹DAVID數(shù)據(jù)庫，因為DAVID不僅是個生物數(shù)據(jù)庫，也是一款在線分析軟件。可以用來做基因的差異分析，也可用于通路的富集。他可以將輸入列表中的基因，關聯(lián)到生...
-
GEO2R instruction
GEO2R instruction 前段時間使用時，發(fā)現(xiàn)數(shù)據(jù)對不上，后來才知道2020年11月GEO2R改版，如果要復現(xiàn)，需要對設置的組進行反轉(zhuǎn)。于是乎，今天把GEO2R的指...
-
利用String數(shù)據(jù)庫和Cytoscape軟件繪制蛋白交互網(wǎng)絡（PPI）Summary String數(shù)據(jù)庫:https://www.string-db.org 是研究網(wǎng)絡藥理學中蛋白質(zhì)相互作用的一個常用數(shù)據(jù)庫，截止今天，已經(jīng)更新到11.0版本。 ...
