參考網頁：https://blog.csdn.net/weixin_43551076/article/details/112197355[https://blog.csdn....
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使用wget下載GEO數據
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申請Gurobi的license
跑一個程序的時候遇到報錯The error message "Model too large for size-limited Gurobi license" or "Mod...
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python模塊intervaltree
參考鏈接：https://pypi.org/project/intervaltree/[https://pypi.org/project/intervaltree/]安裝： ...
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repeat文件下載鏈接
http://labshare.cshl.edu/shares/mhammelllab/www-data/TEtranscripts/TE_GTF/[http://labsh...
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2022-09-22
MetascapeStatistics for Enrichment Analysis | Metascape Blog[http://metascape.org/blog/...
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pacbio數據分析isoseq3官網：但是后面有polish這一步IsoSeq/isoseq-clustering.md at master · PacificBiosciences/IsoS...
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CCS vs. CLR Modes參考網址：https://www.ndsu.edu/pubweb/~mcclean/plsc411/Pacific%20Biosciencs%20CCS%20vs%20CLR...
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Ribo-seq資料pipline參考：https://bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/ORFik/inst/doc/Ribo-...
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nanopore 數據集查詢在ncbi找nanopore三代數據的時候，首先熟悉一下ncbi數據的整理的規則。參考網址：GEO數據庫下載 - 百度文庫 (baidu.com)[https://wenku...
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二代全基因組分析上游分析找到兩個參考網站，也有一些迷惑的地方，我用的第二個網站這里主要討論上游分析，下游分析網站中也有對應的腳本，但是這里不過多討論網站一：https://docs.gdc.canc...
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vep docker下使用vcf2maf跑完全基因組前面的pipline，拿到了vcf文件根據指示把vcf轉化為maf，進一步畫圖統計，使用vcf2maf vcf2maf的git地址為： GitHub - mskc...
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如何下載最新的T2T-CHM13參考基因組2022年3月science發出一系列了關于這個參考基因組的文章 但是怎么下載呢 參考網址： 截至2022年5月，目前的版本有v2.0，v1.1，v1.0等等 因為這個測是一...