R語言報(bào)錯(cuò)，沒有重復(fù)的某一列成為行名，總是報(bào)錯(cuò) 解決方案-把數(shù)據(jù)框轉(zhuǎn)變成matrix
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：福建
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Error in `.rowNamesDF<-`(x, value = value) : missing values in 'row.names' are not allowed -
R包報(bào)錯(cuò)-錯(cuò)誤: package or namespace load failed for ‘org.Hs.eg.db’: loadNamespace()里算'org.Hs.eg.db'時(shí).o...
錯(cuò)誤: package or namespace load failed for ‘org.Hs.eg.db’:loadNamespace()里算'org.Hs.eg.db'...
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R包報(bào)錯(cuò)-Error in `ggplot_add()`
報(bào)錯(cuò)內(nèi)容如下： Error in ggplot_add():! Can't add o to a ggplot object.Run rlang::last_error() ...
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MapQuery error in Seurat reference mapping運(yùn)行MapQuery函數(shù)遇到的問題： 在GitHub上搜到的回答者： 理解是這個(gè)包對(duì)應(yīng)的uwot版本需要更改下就可以了 解決方法：重新更換這個(gè)版本的包，然后再重新啟動(dòng)Rstu...
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生信阿拉丁，為實(shí)用而生
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文件處理-Linux
1 .zip 文件 zip壓縮文件 .zip文件解壓縮 2 .gz 文件 gzip, gunzip, zcat - compress or expand files 3 .t...
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交并補(bǔ)-Linux
(1)兩個(gè)文件的交集，并集前提條件：每個(gè)文件中不得有重復(fù)行 取出兩個(gè)文件的并集(重復(fù)的行只保留一份) 取出兩個(gè)文件的交集(只留下同時(shí)存在于兩個(gè)文件中的文件) 刪除交集，留下其...
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cellranger-初見
安裝軟件 下載人的參考基因組 10×官網(wǎng)給定的 添加軟件目錄到環(huán)境中 運(yùn)行測(cè)試 https://support.10xgenomics.com/single-cell-gen...
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空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序?qū)W習(xí)-樣本準(zhǔn)備和建庫(kù)內(nèi)容來自視頻，網(wǎng)址附后 主要內(nèi)容如下 Tissue Prepartaion and Compatibility Sequencing Minimum Sequencing D...
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single_cell RNA BAM 文件Single cells, reverse transcription (RT) reagents, Gel Beads containing barcoded olig...
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執(zhí)行這個(gè)命令可以解決上述報(bào)錯(cuò)問題
sudo apt-get install gawkscDAPA:從單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中檢測(cè)可變聚腺苷酸化（APA）
多聚腺苷化（polyadenylation，poly(A)）是轉(zhuǎn)錄本成熟過程中在3＇末端發(fā)生的重要修飾步驟。選擇性多聚腺苷化（AlternativePoly(A)，APA）是...
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基因各種ID相互對(duì)應(yīng)的獲取使用這個(gè)網(wǎng)站-bioMarthttp://biomart.genenames.org/martform/#!/default/HGNC?datasets=hgnc_gene_...
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從官網(wǎng)獲得BED文件可以從官網(wǎng)獲得BED文件 http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTables?command=start[http://genome.ucsc.e...
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Dapars尋找APA1.下載ref：https://github.com/ZhengXia/dapars/releases 2.github主頁(yè)：https://github.com/Zheng...
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Chi-Square & Cramér’s V卡方獨(dú)立檢驗(yàn)-判斷兩類因子彼此相關(guān)或相互獨(dú)立的假設(shè)檢驗(yàn) Step1: Chi-Square Independence Test - What Is It? The chi-s...
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gfold 分析之前分析遇到2個(gè)問題：1.樣本只有一個(gè)，沒有replicates，是不是就沒有辦法進(jìn)行分析？2.一個(gè)樣本有3個(gè)重復(fù)，另外一個(gè)只有1個(gè)，怎么進(jìn)行分析？ Jimmy老師給出了提示...
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Error in makeContrasts(contrasts = c(comp), levels = design) : The levels must by syntacticall...前面的步驟是這樣的： 使用limma包進(jìn)行分析的過程中，出現(xiàn)的問題：Error in makeContrasts(contrasts = c(comp), levels = ...
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R報(bào)錯(cuò)-gather & spread 函數(shù)，有新版替代函數(shù)做一個(gè)練習(xí)題，以為很簡(jiǎn)單，但是卻碰到問題 1.將iris數(shù)據(jù)框的前4列g(shù)ather，然后還原 還原 錯(cuò)誤: Each row of output must be identi...
