clusterProfiler包是Y叔開發的一個強大的能進行多種功能富集的R包，對于有OrgDb或AnnotationHub中收錄的物種進行GO和KEGG的富集分析非常的方便...
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IP屬地：上海
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使用clusterProfiler包對非模式生物進行GO和KEGG的富集分析
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cufflinks使用-2 (2018-05-29)
更多請了解Cufflinks: http://cole-trapnell-lab.github.io/cufflinks/ Cufflinks 利用Tophat比對的結果（a...
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RNA-seq：轉錄組數據分析處理（上）（2019/05/07更新）
superqun原創 一、流程概括 RNA-seq的原始數據（raw data）的質量評估 linux環境和R語言環境 raw data的過濾和清除不可信數據（clean r...
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RNA-seq基因可變剪切分析
###因為gtf和fastq的對應關系，從igenome上打包下載所有hg19的信息## 1. tophat2比對 tophat2 -p 15 -G ../reference...
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RNA-seq練習 第二部分（基因組序列下載，注釋文件下載，索引下載，比對，比對質控,HTseq-count計數，輸出count矩陣文件）參考基因組下載有三大全文網站提供參考基因組下載，它們分別是：1.NCBI （https://www.ncbi.nlm.nih.gov/grc）2.UCSC (http://h...
