首先創(chuàng)建一個(gè)項(xiàng)目目錄wes和存放每個(gè)步驟生成文件的子目錄raw, clean, align, genome, hg19_VCF 此流程包含兩個(gè)raw外顯子測(cè)序文件：wes.1...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：湖北
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全外顯子測(cè)序（WES）分析流程
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R語(yǔ)言小技巧
當(dāng)一個(gè)探針對(duì)應(yīng)多個(gè)基因名時(shí)，取第一個(gè) 當(dāng)多個(gè)探針對(duì)應(yīng)一個(gè)基因名時(shí)，取平均值 按照某個(gè)字段的某些字符串進(jìn)行分組 取在所有樣本中count為0不超過(guò)20%的基因 批量算pears...
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R做GSEA富集分析首先感謝Y叔的clusterprofiler神包，做富集分析優(yōu)點(diǎn)是在線爬取數(shù)據(jù)，結(jié)果很可信，但是缺點(diǎn)也是網(wǎng)絡(luò)問(wèn)題，網(wǎng)絡(luò)差點(diǎn)就要等很久，不過(guò)GSEA有自帶GMT文件，因此下載好...
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單細(xì)胞測(cè)序（scRNA-seq）通關(guān)||數(shù)據(jù)處理必知必會(huì)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析系列教程 sc-RAN-seq 數(shù)據(jù)分析||Seurat新版教程:Guided Clustering Tutorial[https://www.jians...
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iTRAQ定量蛋白質(zhì)組筆記(上)
前言 前言 這篇筆記是騰訊課堂上的蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)分析教程的筆記，教程的全稱是《iTRAQ定量蛋白質(zhì)組》教程中涉及到的蛋白質(zhì)譜使用的方法是iTRAQ，分析的物種是玉米，雖然與我的...
