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  • SGE投遞任務

    創建.sh 文件 #!/bin/bash:環境變量#$-cwd:在當前路徑下投遞，SGE日志會輸出到當前目錄#$-S /bin/bash#-j y :-j 將標準輸出與標準錯...

  • perl模塊安裝

    cpanm在系統聯網的情況下，可以自動安裝所需依賴包 下載：wget http://xrl.us/cpanm --no-check-certificate -O /sbin/...

  • 展示基因家族的結構域

    motif與domain motif（模體）是蛋白中較小的保守序列片段，概念比domain小。PROSITE是專門搜索蛋白motif的數據庫，其中signature seqs...

  • linux文本截取

    cut cut以行為處理單位，提取指定區域數據。 cut -bn <file>,以字節（byte）為分割單位-b list 打印出list中指定位置字節，制表符和空格符均為...

  • 基因家族分析策略

    基本分析內容 數據庫檢索與成員鑒定 進化樹構建 保守domain和motif分析 基因結構分析 轉錄組或熒光定量表達分析 數據庫檢索與成員鑒定 1. 數據庫檢索 一般在以下數...

  • Windows下安裝使用circos

    簡介 Circos是通過圓環布局進行數據可視化的軟件包，經常用于基因組數據的可視化展現。 下載安裝 下載地址：http://circos.ca/software/downlo...

  • HTML常用標簽

    基礎標簽 <!DOCTYPE>:定義文檔類型。HTML5中常使用<!DOCTYPE html> : 定義一個HTML文檔，告知瀏覽器這是一個HTML文檔，是除了（[<!DOC...

  • 轉錄組分析工具比較（文獻講讀）

    原文 翻譯版 導讀版來自：生信寶典

  • 配置CPAN

    LOCAL_APP=$HOME/perl5/# local perl editionLOCAL_PERL_EDITION=$LOCAL_APP/perlexport PERL...

  • R繪圖

    heatmap pheatmap 實例 其他1 其他2 其他3 線圖1 線圖2 箱線圖1 箱線圖2 火山圖 韋恩圖 實例 柱狀圖 散點圖 富集分析泡泡圖來自：生信寶典公眾號

  • Cytoscape

    簡介 Cytoscape是一個開源網絡可視化和分析的軟件，提供了網絡顯示、布局、查詢等方面的基本功能。主要用于大規模蛋白質與蛋白質互作，蛋白質-DNA和遺傳交互的分析。 安裝...

  • EVEX查詢數據庫

    簡介 EVEX在線查詢數據庫：http://evexdb.org/，一款以基因為檢索對象，以PubMed和PubMed Central中發表文章的摘要和全文為依據的文本挖掘數...

  • Ensembl數據庫

    簡介 Ensembl ：http://www.ensembl.org/info/data/ftp/index.html，常用的參考基因組和GTF文件下載網站。 Ensembl...

  • Excel插件

    1、全能插件：方方格子 內置了文本處理、批量錄入、刪除工具、合并轉換、重復值工具、數據對比、高級排序等上百個功能。使用說明：http://www.ffcell.com/hom...

  • markdown練習

    簡介 markdown是一種輕量級標記語言，支持嵌入html標簽。markdown語法說明：http://wowubuntu.com/markdown/ 標題 1、用#標記,...

  • 自述

    一個不怎么勤奮的搬運工 本科四年研究生兩年，算得上“入行”許久，然而神馬都一知半解，眼瞅著要畢業到社會上討生活了，決定再發奮努力一把。 本號用來轉載各路文章，記錄學習進度和狀...

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