1、LD連鎖不平衡介紹 (1)LD連鎖不平衡介紹 連鎖不平衡指的是在某一群體中,兩個(gè)基因同時(shí)遺傳的頻率大于隨機(jī)組合的頻率。 用于衡量連鎖不平衡程度的指標(biāo)主要有D、D'和r2三...

基因流(也稱基因遷移)是指從一個(gè)物種的一個(gè)種群向另一個(gè)種群引入新的遺傳物質(zhì),從而改變?nèi)后w“基因庫(kù)”的組成。通過(guò)基因交流向群體中引入新的等位基因,是遺傳變異一個(gè)非常重要的來(lái)源,...
關(guān)于連鎖不平衡的詳細(xì)介紹在之前的帖子里有說(shuō)過(guò),這里就不再贅述,本篇主要介紹LD decay的計(jì)算。1.GWAS:原理與目的 - 簡(jiǎn)書(shū) (jianshu.com)[https:...
1.混合測(cè)序基礎(chǔ) 測(cè)序成本雖然下降了,但對(duì)于植物育種應(yīng)用研究來(lái)說(shuō)還是很高,動(dòng)不動(dòng)就上百群體,小小植物個(gè)體價(jià)值又低,測(cè)完了很可能后面就用不到了。這時(shí),混合樣本測(cè)序是一種省錢的好...
| 轉(zhuǎn)載自G. Corey Shan 的 FDR 和 q-value 最近在做一個(gè)肝癌預(yù)測(cè)的項(xiàng)目,建模使用的數(shù)據(jù)源在The Cancer Genome Atlas (TCGA...
論文 MiDAS 4: A global catalogue of full-length 16S rRNA gene sequences and taxonomy for ...
Perl語(yǔ)言的一大好處就是,在日常處理各種小任務(wù)時(shí),可以利用Perl單行的各種內(nèi)置變量和參數(shù)快捷實(shí)現(xiàn)。本文記錄平時(shí)做分析時(shí)常用的perl內(nèi)置變量、基本參數(shù)和一些常用命令。 個(gè)...
論文 Changes in plant inputs alter soil carbon and microbial communities in forest 本地pdf ...
日常在工作中會(huì)碰到很多數(shù)據(jù)批量處理的問(wèn)題,有的時(shí)候單獨(dú)造輪子很費(fèi)時(shí)間,這個(gè)時(shí)候我發(fā)現(xiàn)了dplyr這個(gè)R包,能幫助你解決數(shù)據(jù)處理中的絕大多數(shù)難題。dplyr是tidyverse...