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  • Restricted cubic spline(RCS):限制性立方樣條

    當我們的自變量和因變量之間不是簡單的線性關系,我們還可以通過多項式回歸,多元線性回歸等方法構造非線性的關系模型,限制性立方樣條(RCS)也是一種選擇。 什么是Restrict...

  • 10x數據熱圖繪制之指定圖例上下限

    錯誤信息 最近處理10x數據,需要把已有的亞群合并,然后繪制目標基因的熱圖~樸實~ 無華~ 枯燥~處理完成之后,需要調整亞群繪制順序,基因的順序OK~ 我改~ one mom...

  • 多線程(一)

    Python中提供了多個模塊來支持多線程編程,包括thread,threading,Queue模塊名等。thread提供了基本的線程和鎖定支持;threading模塊提供了更...

  • MetaStat原理

    一直不清楚MetaStat的腳本輸入到底應該是Read數還是相對豐度,大概過了一下R語言版本的MetaStat代碼的腳本,留此記錄。 代碼解析 R語言版本的MetaStat被...

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    CPGI130原理

    參數選擇 可選的幾個參數 原理解析 A. 按照LENGTH在序列的起始處初始化一個窗口,每次向后移動1bp,直至尋找到符合閾值的一個LENGTH的窗口B. 找到一個符合閾值的...

  • Python 類的一些特殊方法

    Python 類的一些特殊方法 Python 的類中存在一些特殊的方法,使得我們自己構造的類能夠更加清晰并支持某些操作 Code 對象的表示形式 所謂對象的表現形式,在這里可...

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    git(一)--工作流

    為什么從這里開始 也許你對 git 的命令已經很熟悉,能夠熟練的新建一個倉庫,拉取、恢復、Merge你的項目,但每次用的時候依舊會有疑惑 ~ “這玩意兒到底哪里好用了?”。我...

  • Python 的 Click 模塊

    簡介 Click 官方文檔同 argparse 模塊相比,更直觀,更直觀,并且支持 nesting commands類似于 git 那種,除了這個特性支持的比較好,沒覺得簡潔...

  • Python 郵件處理

    基礎概念 POP 和 IMAP 第一個用于下載郵件的協議稱為郵局協議(Post Office Protocal, POP),記錄在 RFC 918 中。郵局協議的目的是讓用戶...

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    Sublime Text 3 使用

    重裝系統,從頭開始配置 安裝 package control 插件管理工具 The simplest method of installation is through th...

  • R語言中的%in%操作符是干什么的?

    判斷前面一個向量內的元素是否在后面一個向量中,返回布爾值。 代碼實例 可以使用這個語法提取向量a中的值

  • CAZy數據庫

    碳水化合物活性酶數據庫(CAZy) 提供了酶分子序列的家族信息,物種來源,基因序列,蛋白序列,三維結構,EC分類,相關數據庫鏈接……建立此數據庫是為了將酶分子的序列、結構、催...

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    seaborn的countplot

    說點什么呢 seaborn是python的一個可視化模塊,構建于matplotlib之上,對于pandas的DataFrame這種數據結構有著很好的支持,能夠大大減少構建繪圖...

  • Matplotlib(3)

    獲取matplotlib的配置文件的路徑 對于在沒有GUI的服務器,備份配置文件之后,更改其中的backend為Agg,便可以后臺輸出了。

  • Matplotlib(2)

    讓輸出更規整 之前一直有一個讓我不得不避開matplotlib的原因便是它那令人蛋疼的輸出。明明在Ipython Notebook中堪稱完美的輸出,換到了服務器端,最終輸出的...

  • Matplotlib(1)

    最近被人問到一些matplotlib的問題,但對答案又一知半解,所以在這里希望加深一下對matplotlib的理解以及使用 簡單的示例 這里我們使用一個簡單的示例來了解mat...

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    GTF/GFF文件的差異及其相互轉換

    我們在做生物分析的時候,經常會碰到GFF格式的文件以及GTF格式的注釋文件。他們有著相似的名字,甚至連內容都極為相似~那么,他們究竟差在哪里呢? GFF全稱為general ...

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