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二代測(cè)序文庫(kù)構(gòu)建-概述與挑戰(zhàn)（1）高通量測(cè)序又稱(chēng)NGS，重新定義了基因組學(xué)研究。近年來(lái)，NGS技術(shù)穩(wěn)步發(fā)展，伴隨著成本下降以及測(cè)序應(yīng)用呈指數(shù)增加。本文，我們研究了影響測(cè)序文庫(kù)質(zhì)量...
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Python基本操作
1.文件讀取與寫(xiě)入 with open(somefile) as f,是比較推薦的讀取文件時(shí)的字段，可自動(dòng)關(guān)閉文件，避免因?yàn)槌绦虮罎⑽醇皶r(shí)寫(xiě)入；...
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Python下載TCGA數(shù)據(jù)-1（自己搗鼓版本）
磕磕絆絆基本學(xué)明白了R，現(xiàn)在用python下載和處理（文件名對(duì)應(yīng)TCGA barcode），主要是通過(guò)任務(wù)帶一下自己對(duì)python的學(xué)習(xí)； 準(zhǔn)備...
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ONENOTE 插入代碼
下載notehighlightReleases · elvirbrk/NoteHighlight2016 · GitHub[https://gi...
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如果GEO數(shù)據(jù)集的表型信息部分串列了
最近搜到GSE21653,提取臨床信息部分，發(fā)現(xiàn)，多個(gè)行出現(xiàn)了，列之間串掉了； 本來(lái)是把整個(gè)下載到的.gz文件解壓后，在txt部分作了更改，但發(fā)...
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Could not resolve host: raw.githubusercontent.com
用github上的包，一直報(bào)錯(cuò)。安裝也報(bào)錯(cuò)了，下載安裝包后，手動(dòng)進(jìn)行了安裝；示例數(shù)據(jù)在github上，就一直報(bào)錯(cuò)。話(huà)不多說(shuō)，上解決方案。 情境 ...
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常用命令1.R里的字符串提取 還是要對(duì)正則表達(dá)式多少了解一些regexpr和regmatches搭配使用，regexpr定位字符串中的指定模式的位置和對(duì)...
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如果裝包報(bào)了錯(cuò)
版本問(wèn)題 DecisionCurve裝包失敗 包名已改為rmda 報(bào)錯(cuò)na.delete function；安裝Hmisc包解決；
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碎碎念-拐個(gè)彎的GEO處理
如果R下載網(wǎng)速不快，可以考慮wget -c下載壓縮包;1)現(xiàn)在windows10 應(yīng)用商城有ubuntu的可兼容版本，適用了下，很好用；2)gi...