這個世界流行離開，但我們卻不擅長告別
發簡信
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@jijitoutou 額，tpm為啥需要標準化，tpm每個樣本的和相等，還需要再標準化一次嗎
Read count、CPM、 RPKM、FPKM和TPM的區別
1. 為什么我們要進行Normalization 測序深度：某些低表達量的基因只有在較高的測序深度時才能檢測到。一般而言，隨著測序深度的增加，基因種類以及可變剪接體的數目也會...
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一般細胞群足夠多，并且不在細分
clustree ： 聚類可視化利器
我們知道在研究問題時，分組是很重要的，有分組才有故事可講。比如，兩塊田一塊施肥一塊不施肥，可以做比較嘛。在單細胞數據分析中用到較多的數據分組技術是聚類（clustering）...
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clustree ： 聚類可視化利器我們知道在研究問題時，分組是很重要的，有分組才有故事可講。比如，兩塊田一塊施肥一塊不施肥，可以做比較嘛。在單細胞數據分析中用到較多的數據分組技術是聚類（clustering）...
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count normalization的方法
count normalization的方法 這應該會是一個小系列，我會簡單介紹下現在的一些count normaliztion的方法，以及對應的代碼解釋、思考，從而最后得出...
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Python黑科技系列11-自動化工具破解VIP付費文章下載數據序言 不要懼怕還未到來的結果，要堅信，人生那么長，執著努力的人，一定會被時光溫柔以待。愿一切為之努力的事情，都有浪漫的結果。不動聲色地變好，每一天都要比昨天更加好。僅此一生，...
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哪個更好呢
Read count、CPM、 RPKM、FPKM和TPM的區別
1. 為什么我們要進行Normalization 測序深度：某些低表達量的基因只有在較高的測序深度時才能檢測到。一般而言，隨著測序深度的增加，基因種類以及可變剪接體的數目也會...
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Read count、CPM、 RPKM、FPKM和TPM的區別1. 為什么我們要進行Normalization 測序深度：某些低表達量的基因只有在較高的測序深度時才能檢測到。一般而言，隨著測序深度的增加，基因種類以及可變剪接體的數目也會...
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跟著Science Advances學畫圖：R語言ggplot2畫圖如何讓坐標軸以科學計數法顯示今天的推文是昨天推文的延續。在昨天的推文中模仿了論文 Landscapes of bacterial and metabolic signatures and their i...
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