作業(yè)要求 我們統(tǒng)一選擇p<0.05而且abs(log2FC)大于1的基因?yàn)轱@著差異表達(dá)基因集,對這個(gè)基因集用R包做KEGG/GO超幾何分布檢驗(yàn)分析。然后把表達(dá)矩陣和分組信息分...
作業(yè)要求 我們統(tǒng)一選擇p<0.05而且abs(log2FC)大于1的基因?yàn)轱@著差異表達(dá)基因集,對這個(gè)基因集用R包做KEGG/GO超幾何分布檢驗(yàn)分析。然后把表達(dá)矩陣和分組信息分...
通過exprs函數(shù)獲取表達(dá)矩陣后我們可以通過以下三種方法判斷是否需要進(jìn)行l(wèi)og2轉(zhuǎn)換 1.肉眼識(shí)別 最簡單粗暴的方法就是,根據(jù)數(shù)值大小粗略估計(jì):如果表達(dá)量的數(shù)值在50以內(nèi),通...
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最近在mac上安裝python和pandas,與windows安裝很順利不同,遇到了不少問題,先記錄下來 首先查看當(dāng)前python版本,這個(gè)是mac os自帶的python ...