為了做RNA-seq自己組了一臺服務器，本來打算印象筆記里存著就好了后來發現好像有蠻多小伙伴也有這樣的需要，那就貼出來給大家參考一下好了。 主板：雙路2011E5主板X79 ...
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無root安裝軟件系列(2022-04-03更新)2022-04-03 更新tree的版本從1.8.0到2.0.22020-11-11 更新htop的下載地址2020-3-13 更新 ncdu的軟件安裝2020-2-13 更...
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新手的R包安裝指南：一條命令就可以把任何來源的R包安裝上啦
太長不看版 只需要使用BiocManager::install()就可以把CRAN、bioconductor、GitHub來源的包都安裝上了。 R包安裝的天下三分 安裝R包是...
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2022《Horticulture Research》| 泛轉錄組+GWAS/eQTL解析茶樹次級代謝物調控網絡2022年7月，劉仁義團隊（福建農林大學）和張興坦團隊（福建農林大學/中國農科院深圳農業基因組研究所）在Horticulture Research期刊（IF=7.291）發表...
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使用anvi'o 進行微生物pangenomics泛基因組分析1.數據下載 2.數據解壓 2.泛基因組數據庫的構建 泛基因組分析 后面還可以對其泛基因組功能進行分析，感興趣的大家去anvio網站學習吧！
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5個有趣的Python腳本Python可以玩的方向有很多，比如爬蟲、預測分析、GUI、自動化、圖像處理、可視化等等，可能只需要十幾行代碼就能實現酷炫的功能。 因為Python是動態腳本語言，所以代碼邏...
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比較基因組分析-數據準備
比較基因組分析，首先需要選定要比較的物種，然后下載這些物種的基因組數據。 基因組數據準備 數據準備1.基因結構注釋文件， gff/gtf格式2.蛋白序列文件，fasta格式3...
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ChIP-seq 分析：Peak 注釋與可視化（9）1. 基因注釋 到目前為止，我們一直在處理對應于轉錄因子結合的 ChIPseq 峰。顧名思義，轉錄因子可以影響其靶基因的表達。 轉錄因子的目標很難單獨從 ChIPseq 數據...
