挖掘公共單細胞數據集時，會遇到常見各種單細胞測序數據格式。現總結如下，方便自己日后調用，以創建Seurat對象（1）barcodes.tsv.gz、features.tsv....
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Seurat包之導入單細胞數據方式匯總 -
Seurat 新版教程：分析空間轉錄組數據隨著轉錄組技術的發展，空間轉錄組已經正式走向商業化時代，作為單細胞數據分析的工具箱的Seurat與時俱進，也相應地開發了空間轉錄組分析的一套函數，讓我們跟隨卑微小王看看Seu...
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關閉PS和AI的版權提示框在使用Adobe系列軟件時，若沒有正版授權，則會出現彈窗，該彈窗是由Adobe Genuine Service 軟件彈出的，且該彈窗無法關閉，下文介紹如何永久關閉該彈窗。（而...
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R語言可視化（四十）：網絡圖繪制40. 網絡圖繪制 清除當前環境中的變量 設置工作目錄 使用igraph包繪制網絡圖 使用ggraph包繪制網絡圖 使用networkD3包繪制動態網絡圖
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ROGUE：評估細胞亞群純度說在前面 我們在前面通過3篇推文介紹了張澤民老師的系列研究成果張澤民老師系列文章解讀(一)[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI4MjY5...
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大數據量單細胞數據處理方式
單細胞數據爆發，現在細胞數據隨便就是萬和百萬級別，除了有許多專門開發出來快速處理百萬級的工具包（例如Cumulus等）和down sample的思想外，為了減輕個人PC內存有...
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RNA-seq入門實戰（六）：GO、KEGG富集分析與enrichplot超全可視化攻略本節概覽：1.獲取DEG結果的上下調差異基因2.bitr()函數轉化基因名為entrez ID3.利用clusterProfiler進行KEGG與GO富集4.用enrichp...
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Seurat 報錯記錄
bug千千萬，改完又忘，忘了又出…… 記錄在Seurat分析中各種各樣的花式bug們???? 1. FindVariableFeatures()報錯 這個是RNA這個assays...
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【基因組學】使用IGV可視化查看基因組重測序比對結果寫在前面IGV能夠將基因組的變異情況可視化，因此廣泛應用于基因組學的研究中。下面我以windows下的IGV為例，介紹一下IGV在查看基因組變異方面的應用。 一.下載 下載鏈...
