results[[2]][["consensusClass"]]就是樣本分成2簇的信息
一致性聚類ConsensusClusterPlus介紹 一致性聚類是一種為確定數(shù)據(jù)集中可能的聚類的數(shù)量和成員提供定量證據(jù)的方法,例如作為微陣列基因表達(dá)。這種方法在癌癥基因組學(xué)中得到了廣泛應(yīng)用,在那里發(fā)現(xiàn)了新的疾病分子亞類。 ...
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一致性聚類ConsensusClusterPlus介紹 一致性聚類是一種為確定數(shù)據(jù)集中可能的聚類的數(shù)量和成員提供定量證據(jù)的方法,例如作為微陣列基因表達(dá)。這種方法在癌癥基因組學(xué)中得到了廣泛應(yīng)用,在那里發(fā)現(xiàn)了新的疾病分子亞類。 ...
您的分享很詳細(xì),幫助挺大,謝謝
R語(yǔ)言ggboxplot-一文掌握箱線圖繪制所有細(xì)節(jié)作者:白介素2相關(guān)閱讀:R語(yǔ)言ggplot2繪制箱線圖R語(yǔ)言生存分析04-Cox比例風(fēng)險(xiǎn)模型診斷R語(yǔ)言生存分析03-Cox比例風(fēng)險(xiǎn)模型R語(yǔ)言生存分析-02-ggforestR...
看到樓上已評(píng)論了,嘻嘻,其實(shí)就是add=“”,這個(gè)參數(shù)來設(shè)置是否顯示點(diǎn)點(diǎn),不想顯示就#掉這個(gè)參數(shù)即可
R語(yǔ)言ggboxplot-一文掌握箱線圖繪制所有細(xì)節(jié)作者:白介素2相關(guān)閱讀:R語(yǔ)言ggplot2繪制箱線圖R語(yǔ)言生存分析04-Cox比例風(fēng)險(xiǎn)模型診斷R語(yǔ)言生存分析03-Cox比例風(fēng)險(xiǎn)模型R語(yǔ)言生存分析-02-ggforestR...
你好,我想請(qǐng)教您一個(gè)問題。readLength這個(gè)參數(shù)后邊接的是質(zhì)控后fastq文件中reads的長(zhǎng)度還是測(cè)序的reads長(zhǎng)度??謝謝啦
2019-08-29 rMATS找可變剪切與可視化python /media/shen/disk1/biosoft/rMATS.4.0.3beta/rMATS-turbo-Linux-UCS4/rmats.py --b1 m...
@劉小澤 好的,謝謝
利用linux處理fq/fa小練習(xí)劉小澤寫于19.1.11知識(shí)就是這樣,越用越熟練,像awk、grep、sed等,用時(shí)間長(zhǎng)了就有感覺了;另外所有我們遇到的問題都能搜索到,所以不用擔(dān)心辦法解決這份題不是我出的,...
你好,有沒有方法能把FQ格式文件數(shù)據(jù)的前50bp提取出來,并保持?jǐn)?shù)據(jù)完整性呢?
利用linux處理fq/fa小練習(xí)劉小澤寫于19.1.11知識(shí)就是這樣,越用越熟練,像awk、grep、sed等,用時(shí)間長(zhǎng)了就有感覺了;另外所有我們遇到的問題都能搜索到,所以不用擔(dān)心辦法解決這份題不是我出的,...
你好,我想請(qǐng)教一下,,做偽時(shí)間的輸入文件是啥樣的?
Monocle擬時(shí)間分析Monocle可以進(jìn)行下面三種類型的分析,可以與seurat無縫連接: 1 對(duì)細(xì)胞進(jìn)行聚類、分組和計(jì)算;2.進(jìn)行擬時(shí)間分析;3.差異表達(dá)分析; 2.Constructing ...
(不是軟文,真實(shí)經(jīng)歷) 萬萬沒想到,在踏入PAIR的辦公室那一天,竟然是將我人生軌跡扭轉(zhuǎn)的開始。 我是一名來自中山大學(xué)的標(biāo)準(zhǔn)中等生,攻讀生物技術(shù)專業(yè),GPA在三等獎(jiǎng)邊緣來回試...
@MC學(xué)公衛(wèi) 對(duì)對(duì)對(duì),我剛問了師兄,他也說是版本問題
實(shí)驗(yàn)記錄3:用R包Seurat進(jìn)行QC、PCA分析與t-SNE聚類版本信息: Seurat v2.0不是3.0!現(xiàn)在Seurat更新了3.0版本,下載也是默認(rèn)的3.0,這篇記錄只適用于用2.0的。 梗概 將Cellranger中的基因表達(dá)矩...
32738個(gè)基因,2700個(gè)細(xì)胞(其實(shí)就是hg19這個(gè)人的單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù))另外有個(gè)問題:matrix.mtx文件的第一列是什么信息?
實(shí)驗(yàn)記錄3:用R包Seurat進(jìn)行QC、PCA分析與t-SNE聚類版本信息: Seurat v2.0不是3.0!現(xiàn)在Seurat更新了3.0版本,下載也是默認(rèn)的3.0,這篇記錄只適用于用2.0的。 梗概 將Cellranger中的基因表達(dá)矩...