發(fā)簡(jiǎn)信
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Python3: LDSC-CTS For GRCh38 流程
0.Installation LDSC V3.0.1 (Python3) GitHub Repository[https://github.c...
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SLURM隊(duì)列系統(tǒng)創(chuàng)建平行陣列任務(wù)
Reference Basic Slurm Commands :: High Performance Computing[https://hpc...
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基于dbSNP 批量注釋Variant （Rs#、POS、ALLELE...）dbSNP（單核苷酸多態(tài)性數(shù)據(jù)庫，Database of Single Nucleotide Polymorphisms） 是由 NCBI（美國(guó)...
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利用 SumStatsRehab 規(guī)范化補(bǔ)全 GWAS數(shù)據(jù)
統(tǒng)一GWAS Summary Statistics格式的重要性與挑戰(zhàn) 在GWAS（全基因組關(guān)聯(lián)研究）分析中，由于缺乏統(tǒng)一的、規(guī)范化的GWAS S...
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ArchR-To-Signac 轉(zhuǎn)換：拓展單細(xì)胞ATAC分析引言 本博客旨在詳細(xì)展示如何將 ArchR 項(xiàng)目中的數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為 Signac 格式對(duì)象，為下游單細(xì)胞 ATAC-seq 數(shù)據(jù)分析提供支持。主要通...
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基于Seurat 整合分析創(chuàng)建“共現(xiàn)熱圖”（co-occurance）通過 共現(xiàn)熱圖(co-occurance heatmap)，我們可以用數(shù)值的方法定量地檢查兩個(gè)數(shù)據(jù)集的重疊程度。基于“最小值和”計(jì)算的重疊分?jǐn)?shù)，...
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基于GWAS結(jié)果的SNP篩選與坐標(biāo)檢索指南
1、關(guān)于潛關(guān)聯(lián)SNP的篩選 篩選疾病風(fēng)險(xiǎn)SNP時(shí)，選擇GWAS p值小于0.05的結(jié)果 并不是一個(gè)最佳的策略，尤其是在全基因組范圍的關(guān)聯(lián)分析中。...
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Seurat::DoHeatmap Clustering Specific GenesReference DoHeatmap clustering specific genes and not top x genes · Issu...
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利用 DuckDB 在 Linux 上高效查詢多種結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)
DuckDB 主要是為結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)查詢?cè)O(shè)計(jì)的，專注于高效處理和分析大規(guī)模數(shù)據(jù)集。它支持多種流行的數(shù)據(jù)存儲(chǔ)格式，如 Parquet、CSV 和 SQ...