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Drug2Cell 安裝及使用教程簡介 Drug2Cell 是用于scanpy中基因組活性評估的效用函數的集合，既用于每個細胞評分，也用于基于標記的富集/過表示分析。Drug2c...
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單細胞測序技術scRNA-seq及其在動物學上的應用《動物學科學研討》課程老師讓介紹一種測序技術，及其在動物學上的應用的，PPT共享！ （每帖分享：時間應該被用在有價值且讓你快樂的地方，而不是無意...
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FeaturePlot畫圖讓有表達的點展示在上方在使用FeaturePlot畫圖的時候會因為細胞太多存在一些細胞被覆蓋的現象，導致表達某基因的細胞由于處于底層而展示不出來。我們如果想要讓表達特...
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利用cellranger構建病毒基因組并整合到人中定量分析1.軟件和參考基因組文件下載 cellranger下載 建議下載比較新的的，我這個是因為想和原文保持一致所以才下載的老版本官網下載：https:...
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R構建seurat和scanpy 重復基因處理方式不同在處理病毒數據的時候遇到一個問題，由于有不同病毒對應的 蛋白編碼基因相同，導致讀取的時候出現問題：主要是在R中"ORF1ab"讀取為0但是sca...
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destiny包安裝 (libstdc++.so.6報錯)為了使用DiffusionMap，需要安裝destiny，但是遇到報錯libstdc++.so.6: version GLIBCXX_3.4.3...
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Rstudio server卡住無法啟動多次遇到rstudio-server服務器自己的用戶登錄不上，一直卡著，但是別人的用戶能正常使用的情況，一般都是自己用戶下出現了問題，下面總結幾...
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ROGUE： 細胞亞群純度評估在多篇高分文章中都出現了評估細胞亞群純度的內容，用到的是張澤民團隊的ROGEU包。提出了一個基于熵的統計量(ROGUE)來準確地定量鑒定的細胞團...
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SeuratDisk R包安裝 & .h5ad轉換為seurat對象h5Seurat 文件格式專門用于存儲和分析多模態單細胞和空間分辨表達實驗數據，例如來自 CITE-seq 或 10X Visium 技術的數據...