發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：山東
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【Rna-seq 分析流程】12. 藥物預(yù)測(cè)與分子對(duì)接1. 簡(jiǎn)介 預(yù)測(cè)與AAV相關(guān)的潛在藥物，并探究AAV發(fā)病過程中的關(guān)鍵基因與潛在藥物之間的相互關(guān)系。 2. 數(shù)據(jù)信息 關(guān)鍵基因基因名 3. 思路 ...
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【Rna-seq 分析流程】11. GeneMANIA和分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)1. 簡(jiǎn)介 推測(cè)關(guān)鍵基因的作用和調(diào)控機(jī)制， 可以通過關(guān)鍵基因與其功能相似基因之間的相互作用和功能，進(jìn)行類比； 通過研究關(guān)鍵基因mRNA，miRN...
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【Rna-seq 分析流程】10. RNA甲基化修飾1. 簡(jiǎn)介 研究RNA甲基化修飾與AAV之間的內(nèi)在聯(lián)系，有助于揭示AAV的發(fā)病機(jī)制，為開發(fā)新的診斷標(biāo)志物和治療靶點(diǎn)提供理論依據(jù)，從而為精準(zhǔn)治療開...
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【Rna-seq 分析流程】09. 免疫浸潤(rùn)分析1. 簡(jiǎn)介 AAV與免疫細(xì)胞關(guān)系密切，在該疾病發(fā)生時(shí)，各類免疫細(xì)胞會(huì)被異常激活，探究AAV發(fā)生發(fā)展過程中免疫細(xì)胞的變化情況及其它們之間的相互關(guān)系...
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【Rna-seq 分析流程】08. GSEA分析1. 簡(jiǎn)介 GSEA分析可以揭露關(guān)鍵基因在AAV發(fā)展過程中參與的相關(guān)信號(hào)通路，以了解關(guān)鍵基因在生物過程中的作用。 2. 數(shù)據(jù)信息 org.Hs....
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【Rna-seq 分析流程】07.關(guān)鍵基因定位和相關(guān)性分析1. 簡(jiǎn)介 了解關(guān)鍵基因所在區(qū)域的染色質(zhì)結(jié)構(gòu)和表觀遺傳特征對(duì)關(guān)鍵基因表達(dá)的影響。 2. 數(shù)據(jù)信息 人類基因注釋: UCSC.HG19.Human...
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【Rna-seq 分析流程】06. 列線圖的構(gòu)建1. 簡(jiǎn)介 列線圖（Alignment Diagram），又稱諾莫圖（Nomogram圖）根據(jù)多因素回歸分析的結(jié)果，將多個(gè)預(yù)測(cè)指標(biāo)整合并可視化到...
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【Rna-seq 分析流程】05. Wilcoxon秩和檢驗(yàn)比較1. 簡(jiǎn)介 為了觀察特征基因在訓(xùn)練集和驗(yàn)證集中是否具有一致的表達(dá)趨勢(shì)，在訓(xùn)練集和驗(yàn)證集所有樣本中，通過 Wilcoxon秩和檢驗(yàn)比較AAV組樣本...
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【Rna-seq 分析流程】04 機(jī)器學(xué)習(xí)-構(gòu)建風(fēng)險(xiǎn)模型1. 簡(jiǎn)介 基于轉(zhuǎn)錄組訓(xùn)練集中所有樣本，構(gòu)建風(fēng)險(xiǎn)模型，篩選基因機(jī)器學(xué)習(xí)方法： LASSO 邏輯回歸算法構(gòu)建模型篩選候選基因 SVM-RFE 向量...