發簡信
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細菌全基因組測序數據構建SNP系統發育樹
本次分析使用到的數據及數據處理流程參考文獻“https://doi.org/10.1186/s13756-018-0352-y[https://...
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【宏基因組入門教程】（一）
最近接手了宏基因項目，會在之后接著發一系列的宏基因組入門教程，學習資料大概來自國外的教程。感謝Harriet Alexander, Phil B...
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"Perl lib version vXX doesn't match executable version vXX" 問題解決
裝idba的時候遇到一個小問題，執行“./build.sh”總是會報錯：/usr/bin/aclocal: Perl lib version (...
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細菌基因組下載
最近需要盡可能的下載細菌基因組，ncbi ftp站點（ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes）里面"all"這個目...
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生物信息python 入門題 初級至進階
本文水平有點low，本來不打算寫這么低水平的文章，怎奈我的python水平就在這么low的水平。以此貼記錄初試python解決生信簡單問題的學習...
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基因組組裝結果中去除細胞器序列
如果沒有該基因組細胞器序列，需要先組裝細胞器序列，再比對去除 如果有了該基因組的細胞器基因組（如公開數據庫可獲取），通過比對去除 細胞器基因組組...
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wtdbg 組裝基因組
關鍵詞：pacbio; nanopore; assemble wtdbg相較于其他三代四代數據組裝軟件（Canu，smartdenovo，min...
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nanopore數據組裝人類基因組Sergey Koren和Adam Phillippy提出了一種“trio binning”組裝策略組裝人的基因組單倍型。兩位大神參與了多個組裝...