發簡信
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gseKEGG和enrichKEGG的差別
clusterProfiler 是一個在 R 語言中用于功能注釋分析和可視化的強大工具。它提供了多種方法來分析和解釋高通量生物學數據集。gseK...
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使用GeneSet 生成GeneSetCollection 基因集對象
代碼來自曾老師的某乎推文 《對象何必到處亂找，自己創造即可》使用的時候老報錯，就給他分解了一下，查找了原因，解決了一下。主要的代碼就是 Gene...
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處理報錯：ggplot2折線圖報錯，不出折線，沒有線，成點圖了？! Do you need to adjust the group aesthetic?師姐讓畫一個關于動物體重隨時間變化的折線圖，不會用prism，所以就用R ggplot2 去畫函數代碼很簡單ggplot(dat_se, aes...
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GEO RAW.tar ‘原始數據?’ 讀取，獲得表達矩陣。最近在下載GEO數據的時候，下載到了一個這個，GSE41789_RAW， 下載后的數據是一個壓縮包，解壓縮后 是這個樣子的。 第一次使用這種數據...
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將文件導入R 新手村任務 導入R 一大門檻Error: unexpected input in "gse72815 <- read.table('Referdatacounts/GSE7...
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小函數收集
base包的 Signif 函數用于保留向量/numeric 的小數點位數用法：Signif(x, digits = 4, force = TR...
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人鼠基因名同源轉換首先可以直接大小寫轉換： 但是這樣還是存在很多例如 TP53 和 小鼠的Trp53直接轉換后不對應的問題。于是考慮到要同源轉換。但是看了很...
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pheatmap 熱圖雙層標簽前段時間在學習的時候看到了簡書更新，覺得小明哥的這種做法稍顯復雜，作為R小白，我之前一直在用pheatmap做熱圖，所以覺得做這種圖片還是熱圖來...
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根據熱圖刪基因 pheatmap 2.0
根據熱圖刪基因 pheatmap - 簡書 (jianshu.com)[http://www.lxweimin.com/p/f6bb27d7f1...