IP屬地：北京
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統(tǒng)計fastq文件read長度及read平均長度
轉(zhuǎn)錄組分析使用stringtie定量后，如果使用DESeq2進(jìn)行下游分析，需要使用prepDE.py生成read counts矩陣，prepDE...
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修改stringtie、ballgown 結(jié)果中部分gene_id為ref_gene_id
問題：stringtie組裝轉(zhuǎn)錄本后會改變原本參考基因組注釋文件中的gene_id stringtie 組裝、merge的stringtie_m...
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TaWRKY19 抑制TaNOX10表達(dá)，降低ROS反應(yīng)，降低小麥條銹病抗性One-sentence summary:TaWRKY19 transcriptionally represses the expression...
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根瘤菌tRF調(diào)節(jié)大豆結(jié)瘤作者發(fā)現(xiàn)根瘤菌中三個轉(zhuǎn)運RNA產(chǎn)生的small RNA可以進(jìn)入大豆根毛細(xì)胞，并結(jié)合AGO1降解植物中與根毛卷曲、根瘤菌侵染相關(guān)的5個基因的mRN...
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黃學(xué)輝老師報告記錄
全基因組關(guān)聯(lián)分析在植物中面臨的挑戰(zhàn)：1、在自然群體中對復(fù)等位基因控制的性狀進(jìn)行分析有些困難2、難以定位群體中的稀有突變增加群體大小3、最大挑戰(zhàn)：...
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dN/dS (Ka/Ks) 原理及計算方法CONCEPTS In genetics, dN/dS also known asor Ka/Ks, is used to estimate t...
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對26份大豆進(jìn)行De Novo組裝并構(gòu)建大豆泛基因組1 Introduction Pan-genome 相比傳統(tǒng)線性Reference genome具有的優(yōu)點： 包含物種所有的基因，主要體現(xiàn)在可以...
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水稻蛋白質(zhì)系統(tǒng)進(jìn)化樹構(gòu)建方法
利用最大似然法構(gòu)建水稻蛋白系統(tǒng)進(jìn)化樹 1 蛋白序列獲取 在MSU上檢索蛋白序列，最終檢索獲取到770條蛋白序列。 2 多序列比對 利用CLUST...
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作物遺傳改良助力優(yōu)美稻田“綠色減排”
今年的4月22日是第50屆世界地球日，慶祝主題為“Climate Action”。我國地球日宣傳活動周的主題為“珍愛地球,人與自然和諧共生”。全...