發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：江蘇
-
fasta文件多行變一行，按序列長(zhǎng)度排序
統(tǒng)計(jì)fasta序列長(zhǎng)度 Method 1 多行變一行 按sequence length從大到小排序 運(yùn)行： Reference: https:/...
-
MLST分型MLST 軟件下載地址：https://github.com/tseemann/mlst[https://github.com/tseemann...
-
用QUAST評(píng)估基因組組裝
QUAST是什么 QUAST(Quality Assessment Tool for Genome Assemblies)是基因組質(zhì)量評(píng)估工具，...
-
BUSCO評(píng)估基因組完整性
官網(wǎng) https://busco.ezlab.org/[https://busco.ezlab.org/] 1、在線工具（http://useg...
-
diamond安裝及使用
軟件github：https://github.com/bbuchfink/diamond?tab=readme-ov-file#readme[...
-
MAFFT軟件安裝及使用（Ubuntu）
序列比對(duì)軟件（其他類(lèi)似軟件：muscle, T-Coffee, ClustalW） 軟件網(wǎng)址：https://mafft.cbrc.jp/ali...
-
snippy + iqtree進(jìn)行SNP分析及進(jìn)化樹(shù)繪制
1、使用snippy流程對(duì)多個(gè)組裝的結(jié)果進(jìn)行snp分析參考：https://zhuanlan.zhihu.com/p/558110833[htt...
-
從fasta文件中提取指定位置的序列
基因組的fasta文件很大，只想要指定位置的序列，用linux腳本從fasta文件中提取指定位置的sequences。