??真核生物基因是不連續性的（間斷基因，Split gene），通過RNA剪接實現內含子的去除與外顯子的拼接，最終產生功能性RNA與蛋白質。以往，針對剪接現象的認識是：剪接復合體通過識別內含子的5’剪接位點，3'剪接位點和分支位點，實現內含子的一次性移除（圖：剪接模型，conventional splicing）。而之后，有研究報道，在比較長的內含子中存在遞歸剪接（recursive splicing）現象：在intron中存在著一些遞歸剪接位點，它們具有類似3’剪接位點，5'剪接位點的特征，只是在剪接位點中不存在其他序列，即為零外顯子（沒有長度的外顯子）；內含子最上游的5’剪接位點通過與遞歸剪接位點中的3'剪接位點協同發生剪接，接著與下一個剪接位點發生剪接，直至最后與外顯子毗鄰的3’剪接位點進行剪接，從而實現多次j剪接移除一個內含子的目的（圖：剪接模型，recursive splicing）。而在這些剪接模型中，剪接位點的選擇是按順序的：上游的5’剪接位點與最近的3'剪接位點發生剪接，依次推進。
??而今天分享的這項研究則發現：（1）遞歸剪接現象比已報道的更為普遍；（2）遞歸剪接中剪接位點的選擇并不是按距離遠近選擇的，而是隨機選擇。
三言兩語
U2AF結合多聚嘧啶與3'剪接位點上，而本研究中發現，U2AF在一些內含子中存在多個結合位點，提示存在比較普遍的內含子內部剪接位點。
基于去分支酶沉默或者缺陷的樣本的套索RNA（內含子剪切下來形成的環狀RNA）測序則發現：套索RNA的大小相比內含子大小偏小；存在有內含子內部剪接位點介導形成的套索RNA。這些提示內含子中的剪接位點的確參與剪接事件。
利用內含子報告載體結合單細胞成像技術，研究者發現，內含子內部的剪接位點在剪接過程中的選擇是隨機的。
Reference
Wan, Y. et al. Dynamic imaging of nascent RNA reveals general principles of transcription dynamics and stochastic splice site selection. Cell 184, 2878-2895 e2820 (2021).
