膠原蛋白種類較多，常見類型為Ⅰ型、Ⅱ型、Ⅲ型、Ⅴ型和Ⅺ型。
膠原蛋白是一類蛋白質家族，已至少發現了30余種膠原蛋白鏈的編碼基因，可以形成16種以上的膠原蛋白。根據其結構，可以分為纖維膠原、基膜膠原、微纖維膠原、錨定膠原、六邊網狀膠原、非纖維膠原、跨膜膠原等。根據它們在體內的分布和功能特點，可以將膠原分成

間質膠原、基底膜膠原和細胞外周膠原。
間質型膠原蛋白分子占整個機體膠原的絕大部分，包括Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ型膠原蛋白分子，Ⅰ型膠原蛋白主要分布于皮膚、肌腱等組織，也是水產品加工廢棄物（皮、骨和鱗）含量最多的蛋白質，占全部膠原蛋白含量的80-90%左右，在醫學上的應用最為廣泛。Ⅰ型膠原在魚類膠原中一個最顯著的的特點是熱穩定性比較低，并呈現有魚種的特異性。Ⅱ型膠原蛋白由軟骨細胞產生；
基底膜膠原蛋白通常是指Ⅳ型膠原蛋白，其主要分布于基底膜；
細胞外周膠原蛋白通常中指Ⅴ型膠原蛋白，在結締組織中大量存在。按功能，可將膠原分為兩組，第一組是成纖維膠原，包括第Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅺ、Ⅹ、ⅩⅣ和ⅩⅩⅦ型膠原；其余是第二組，非成纖維膠原。非成纖維膠原的α- 鏈既含有三螺旋域（膠原域，COL），還含有非三螺旋域（非膠原域，NC），其中成纖維膠原約占膠原總數的90%。

COL1A1：collagen type I alpha 1 chain
COL1A2：collagen type I alpha 2 chain
COL12A1：
COL18A1：
COL27A1：
COL4A1：
COL4A2：
COL4A3BP：
COL4A5：
COL6A2：
COL7A1：
COLGALT1：