做轉錄調控,少不了這幾個工具網站

關于轉錄調控的科研網站,我找到了幾個有用的資源:

燈塔索引(dotaindex):整合了全部轉錄調控相關的網站,可以搜轉錄因子,可以搜結合位點。同時還包含泛素化修飾,rna調控等多個網站,方便快捷。

TRRUST:轉錄因子調控網絡專用數據庫:這是一個專注于人類和小鼠轉錄因子及其靶基因的可信關系數據庫。它提供了豐富的數據資源,有助于轉錄調控相關的研究。

PlantRegMap:植物轉錄調控網絡數據平臺:由北京大學蛋白質與植物基因研究國家重點實驗室高歌研究員課題組開發,提供了關于植物轉錄因子和轉錄調控的數據與分析平臺。該平臺包含轉錄因子結合位點預測、轉錄調控預測與富集分析等工具,涉及165個植物物種。

PlantTFDB:植物轉錄因子數據庫:提供了關于植物轉錄因子的家族分類規則、基因組轉錄因子全譜、豐富的注釋等信息,覆蓋了擬南芥、水稻、楊樹、大豆、玉米、小麥等165個物種。

Ensembl:由歐洲生物信息學研究所和英國桑格研究院合作開發的Ensembl數據庫,支持比較基因組學、進化、序列變異和轉錄調控的研究。該數據庫提供了廣泛的工具和資源,用于探索基因序列和轉錄調控。

TransmiR 3.0:轉錄因子-miRNA調控更新數據庫:專注于miRNA及其調控網絡的研究,提供了豐富的TF-miRNA調控關系和詳細注釋,涉及29個物種。

這些網站提供了豐富的資源和工具,可以幫助您在轉錄調控研究領域取得進展。

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