R之Bayes分析-很爛的使用說明

*僅供實驗室內部使用,文中所提到的文件在實驗室電腦上“貝葉斯檢驗”文件夾下

一、安裝R

安裝

或到官網下載最新版本:

https://www.r-project.org/

二、安裝Package


需要安裝‘BayesFactor’ package和它的Depends packages(詳見BayesFactor.pdf)

這幾個在packages文件夾下都有,也可去網上下載最新版。

https://cran.r-project.org/web/packages/BayesFactor/index.html

怎么安裝的我實在是想不起來了,大概是在R里運行下這個:

install.packages('BayesFactor')

*先install Depends的 coda、knitr、markdown,最后再install BayesFactor

安裝后運行:

library(BayesFactor)

沒有報錯應該就是可以的,報錯有時候是操作問題(安裝順序等問題),有時候可能是電腦的問題,可以換電腦試下。

三、計算BayesFactor


官方說明見:貝葉斯檢驗\BayesFactor\doc\index.html

代碼參考:貝葉斯檢驗\檢驗結果\bfANOVA.docx

建議先做方差分析/t檢驗,和spss的統計結果比對是否一致,一致的話再繼續計算BayesFactor。

數據的錄入我是采用的最原始的方法,直接輸進去的(當然所謂直接輸進去不是一個一個敲進去,是用excel轉換格式粘進去的)

對BayesFactor值的解釋建議看文件夾里面的文獻。

大約是:計算出的BayesFactor= 備擇假設為真的概率/零假設為真的概率。文獻中一般會取倒數反過來報告。倒數一般大概需要接近或大于3才比較有利于支持零假設。

2016.9.11?

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