文獻(xiàn)閱讀|Contentious relationships in phylogenomic studies can be driven by a handful of genes

Shen, X.-X., Hittinger, C.T., Rokas, A., 2017. Contentious relationships in phylogenomic studies can be driven by a handful of genes. Nature Ecology & Evolution 1, 0126.. doi:10.1038/s41559-017-0126

雖然生信的課程已經(jīng)看了兩三個(gè),但生信領(lǐng)域的教授專家們都在研究什么我并不是太了解,所以接下來打算多看看生信相關(guān)的文獻(xiàn)。

很多東西都不太懂,但大致了解了這個(gè)研究的思路和目的,總結(jié)如下:

  • 起因
    研究者發(fā)現(xiàn)通過不同的分析方法,由于生物和分析等因素的影響,系統(tǒng)發(fā)育的推斷會(huì)有所偏差。
  • 目的與思路
    通過生物信息學(xué)分析,探討為什么會(huì)有矛盾的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)的產(chǎn)生。通過精確量化系統(tǒng)發(fā)育信號(hào),并識(shí)別導(dǎo)致這種沖突的基因或位點(diǎn)。
    解剖系統(tǒng)發(fā)育信號(hào)的分布,最終解決關(guān)于后生動(dòng)物最早分支門的爭議。
  • 研究對(duì)象
    研究者研究了植物、動(dòng)物和真菌的三個(gè)大型系統(tǒng)基因組數(shù)據(jù)矩陣中17個(gè)有爭議的分支和6個(gè)成熟分支(作為對(duì)照)的系統(tǒng)發(fā)育信號(hào)分布。
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