2018-03-08 計算生物學筆記(有點亂)

開始:信源
過程:信道
結束:信宿

一個基本模型:
信源 ——編碼——信道——解碼——信宿

信道 (可能中間產生干擾)

信息量:信息是否可以量化
信息熵:信息在系統中維生

物質熵:
負熵 —— 系統可以維生
正熵 —— 消耗

信息熵:

補充信息
比如說一個人坐牢,給他吃喝,不給他信息補充,信息消耗,直到消亡

信息也是生存的重要因素

一個系統存在(能量,物質,信息)

信息量:

與概率有關系。

A1 A2 A3 A4 A5 A6 A7 A8
1/4 1/4 1/8 1/8 1/16 1/16 1/16 1/16

A1 A2 一組 E0
E00 E01

其余一組 E1

E 1 分兩座

E10 ( E100 E101)

E11 ( E1100 E1101 E1110 E1111)

后面的數字 是編碼位數。與概率有關系。

hi = log 2 1/pi

hi 就是信息量

假設一段核酸序列(3個一組)
AAA AAC AAG AAT ...

p=1/64

hi = log 4 1/1/64

信息熵:

平均位數 (2+2+3+3+4X4)/8

Pi X log 2 1/p

就是平均位數

若都是等概率的情況
信息熵最大

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