三十六策 第 14 策 三才合一
KEGG 把通路分為七大類，是全面覆蓋的分法:
第一類是代謝;
第二類是遺傳信息傳遞，包括基因轉錄、翻譯、蛋白轉運、降解等;
第三類是環境信息傳遞，包括膜轉運和信號傳導，這是疾病中最活躍的一類，跟醫學研究息息相關，那些百搭通路基本都在這里面;
第四類是細胞生物學過程，包括細胞周期、凋亡、自噬、粘附等表型，一個表型就是一個通路;
第五類按照器官系統來分類的，有神經系統、循環系統、免疫系統等等;
第六類是疾病，
第七類是藥物。
通路芯片+Western 就是基本上百分百能做出機制的萬全策略。
二元變量的 4 種模式是多元變量關系的基本構成單元，而三元恰好回答了一個研究對象，往上找驅動因素，往下找效應環節的邏輯閉環，形成了一個完整的科學故事結構。它調控了誰，以及它被誰調控都照顧到了。
基礎研究中的三元變量就是解答了一個科學現象也就是表型背后的三個關鍵科學問題: 主變量是誰?被上游哪個因變量調節?下游調節哪個因變量?
三元變量要先拆分成二元結構來整理，然后再證明三元間的必要性(Rescue 驗證)。先兩兩配對把調控關系證明完，然后 Rescue 把變量串起來。假設課題創新性在分子上，藥物+分子+通路中把分子作為主變 量，那么藥物就是分子上游的驅動因素，對藥物來說分子是新發現的作用靶點，而通路是分 子下游的效應環節，這是一套很規整的科學假設框架。
藥物+分子+通路
三元變量論證，根據二元邏輯拆解開有
三組關系:1)藥能調分子;2)分子能調通路;3) 藥能調通路。
還有一組必要性論證，也就是 4)Rescue 環節:藥調節通路依賴分子。然后跟表型相關的 Rescue 還有三條:1)藥物調節表型依賴分子;2)分子調節表型依賴于通路，3)藥物調節表型依賴于通路。
再加上兩個二元關系的直接作用細節:1)藥怎么調節分子;2)分子又怎么作用于通路的具體機制
假設藥物和通路調節表型已知，那么上一策講過的二元變量論證三條原封不動: 1)分子調節表型;2)分子調節通路;3)分子調節表型依賴于通路。還需要再加上 4)藥物調節分子和通路;5)藥物調節表型依賴于分子，一共 5 條關鍵證據鏈。
