EnsemblePlants植物基因組數(shù)據(jù)庫有直接的FTP服務(wù)器
本教程教你如何使用著名的lftp包下載這一大型數(shù)據(jù)庫
第一步，安裝lftp相關(guān)包

sudo apt-get install lftp    #安裝lftp

第二步，運(yùn)行l(wèi)ftp

sudo lftp    #運(yùn)行l(wèi)ftp

第三步，設(shè)置本地目錄

lcd /home/bohan/ensembleplantsgenome    #設(shè)置本地目錄

第四步，登錄服務(wù)器

lftp ftp://ftp.ensemblgenomes.org/pub/plants/release-44/fasta/    #通過匿名方式登錄服務(wù)器

第五步，將服務(wù)器目錄鏡像下載至本地

mirror -c -e -n --parallel=20 ftp://ftp.ensemblgenomes.org/pub/plants/release-44/fasta/ /home/bohan/ensembleplantsgenome     #同時(shí)使用20個(gè)線程同步下載相應(yīng)目錄至本地

運(yùn)行成功后，可以通過jobs命令查看當(dāng)前運(yùn)行的下載任務(wù)

jobs -v    #查看目前進(jìn)行任務(wù)

也可以直接按ctrl+c退出轉(zhuǎn)入nohup模式繼續(xù)

也可以在退出后當(dāng)前終端linux控制臺(tái)
使用jobs和bg命令將當(dāng)前進(jìn)程轉(zhuǎn)入后臺(tái)

jobs         #顯示當(dāng)前終端運(yùn)行的任務(wù)
[1] mirror -c -e -n --parallel=20 ftp://ftp.ensemblgenomes.org/pub/plants/release-44/fasta/ /home/bohan/ensembleplantsgenome
bg %1        #將jobs命令顯示出的1號(hào)任務(wù)轉(zhuǎn)為后臺(tái)

mirror 命令參數(shù)

-c, --continue         支持?jǐn)帱c(diǎn)續(xù)傳if possible
-e, --delete           如果遠(yuǎn)程目錄下已經(jīng)沒有某個(gè)文件，而本地有，則刪除這個(gè)文件。
     --delete-first     在下載新文件之前先刪除舊的文件
-s, --allow-suid       保留遠(yuǎn)程目錄中設(shè)定的用戶及組權(quán)限
     --allow-chown      設(shè)置下載文件的所有者和所屬組
     --ignore-time      屏蔽時(shí)間判定，這樣mirror只通過大小來判斷文件，同步速度可以加快。
-n, --only-newer       只下載新的文件，mirror的判定新文件是通過文件大小和修改時(shí)間來判定的(這時(shí)候-c不能使用)
-r, --no-recursion     不下載子目錄中的文件，即沒有遞歸的功能
-p, --no-perms         不設(shè)置下載后文件的訪問權(quán)限
     --no-umask         don't apply umask to file modes #這個(gè)不知道怎么翻譯
-R, --reverse          上傳到FTP
-L, --dereference      download symbolic links as files #這個(gè)不知道怎么翻譯
-N, --newer-than=SPEC  只下載某個(gè)特定時(shí)間以后更新過的文件
-P, --parallel[=N]     同時(shí)下載N個(gè)文件
-i RX, --include RX    下載時(shí)包含的文件名稱，RX表示正則表達(dá)式
-x RX, --exclude RX    下載時(shí)不包含的文件名稱，RX表示正則表達(dá)式
-v, --verbose[=N]      關(guān)于操作的詳細(xì)輸出。
     --log=FILE         將已經(jīng)執(zhí)行過的lftp命令寫入文件
     --script=FILE      將lftp命令寫入文件，但不執(zhí)行