歷史上的原因是，openjdk是jdk的開放原始碼版本，以GPL協議的形式放出。在JDK7的時候，openjdk已經成為jdk7的主干開 發，sun jdk7是在openjdk7的基礎上發布的，其大部分原始碼都相同，只有少部分原始碼被替換掉。使用JRL(JavaResearch License，Java研究授權協議)發布。

至于openjdk6則更是有其復雜的一面，首先是openjdk6是jdk7的一個分支，并且盡量去除Java SE7的新特性，使其盡量的符合Java6的標準。

關于JDK和OpenJDK的區別，可以歸納為以下幾點：

一.授權協議的不同：

openjdk采用GPL V2協議放出，而JDK則采用JRL放出。兩者協議雖然都是開放源代碼的，但是在使用上的不同在于GPL V2允許在商業上使用，而JRL只允許個人研究使用。

二.OpenJDK不包含Deployment（部署）功能：

部署的功能包括：Browser Plugin、Java Web Start、以及Java控制面板，這些功能在Openjdk中是找不到的。

三.OpenJDK源代碼不完整：

這個很容易想到，在采用GPL協議的Openjdk中，sun jdk的一部分源代碼因為產權的問題無法開放openjdk使用，其中最主要的部份就是JMX中的可選元件SNMP部份的代碼。因此這些不能開放的源代碼 將它作成plug，以供OpenJDK編譯時使用，你也可以選擇不要使用plug。而Icedtea則為這些不完整的部分開發了相同功能的源代碼 (OpenJDK6)，促使OpenJDK更加完整。

四.部分源代碼用開源代碼替換：

由于產權的問題，很多產權不是SUN的源代碼被替換成一些功能相同的開源代碼，比如說字體柵格化引擎，使用Free Type代替。

五.openjdk只包含最精簡的JDK：

OpenJDK不包含其他的軟件包，比如Rhino Java DB JAXP……，并且可以分離的軟件包也都是盡量的分離，但是這大多數都是自由軟件，你可以自己下載加入。

六.不能使用Java商標：

這個很容易理解，在安裝openjdk的機器上，輸入“java -version”顯示的是openjdk，但是如果是使用Icedtea補丁的openjdk，顯示的是java。（未驗證）

總之，在Java體系中，還是有很多不自由的成分，源代碼的開發不夠徹底，希望Oracle能夠讓JCP更自由開放一些，這也是所有Java社區所希望的