參考 http://www.lxweimin.com/p/a63595a41bed # 生信技能樹推文
1、DNA鏈的基本概念
正鏈和負(fù)鏈 : DNA中反向互補的鏈。參考基因組給出的那個鏈就是所謂的正
鏈(forword),另一條鏈?zhǔn)欠存湥╮everse)。
正義鏈(sense strand):兩條互補的DNA鏈其中一條攜帶編碼蛋白質(zhì)信息的鏈稱為正義鏈,又稱編碼鏈,因為它的序列與mRNA相同。
反義鏈(antisense strand):另一條與之互補的稱為反義鏈。而反義鏈雖然和RNA反向互補,但它可是真正給RNA當(dāng)模板的鏈,因此反義鏈也是模板鏈。
正義鏈(sense strand)= 編碼鏈(coding strand)= 非模板鏈
反義鏈(antisense strand)= 模板鏈 (和編碼鏈反向互補)
forword strand = sense strand + antisense strand
reverse strand = sense strand + antisense strand
2、鏈特異性測序
建庫方式以dUTP為例,首先用隨機引物合成RNA的第一條cDNA,合成第二條cDNA時用dUTP替代dTTP,加adaptor后用UDGase處理,將有U的第二條cDNA降解,只留下含有U的第一條cDNA,dDTP=fr-firststrand。 firststrand非RNA strand(即非正義鏈)
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