參考 http://www.lxweimin.com/p/a63595a41bed # 生信技能樹推文

1、DNA鏈的基本概念

正鏈和負(fù)鏈 : DNA中反向互補的鏈。參考基因組給出的那個鏈就是所謂的正
鏈（forword），另一條鏈?zhǔn)欠存湥╮everse）。

正義鏈（sense strand）：兩條互補的DNA鏈其中一條攜帶編碼蛋白質(zhì)信息的鏈稱為正義鏈，又稱編碼鏈，因為它的序列與mRNA相同。

反義鏈（antisense strand）：另一條與之互補的稱為反義鏈。而反義鏈雖然和RNA反向互補，但它可是真正給RNA當(dāng)模板的鏈，因此反義鏈也是模板鏈。

正義鏈（sense strand）= 編碼鏈（coding strand）= 非模板鏈
反義鏈（antisense strand）= 模板鏈 （和編碼鏈反向互補）
forword strand = sense strand + antisense strand
reverse strand = sense strand + antisense strand

2、鏈特異性測序

建庫方式以dUTP為例，首先用隨機引物合成RNA的第一條cDNA,合成第二條cDNA時用dUTP替代dTTP，加adaptor后用UDGase處理，將有U的第二條cDNA降解，只留下含有U的第一條cDNA,dDTP=fr-firststrand。 firststrand非RNA strand(即非正義鏈)

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