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意識和肉體關系：2個極端，一個是唯物論的僅有肉體沒有精神，另一個是唯心論的僅有精神感覺沒有物質。2極端中，有精神肉體相對獨立的二元論(同一硬幣兩面)，以及精神肉體相互聯系而又分屬不同層次的二元論(精神是神經細胞活動的整體結果)。另一種二元論認為精神是一種類似程序(軟件)而肉體是硬件。精神和肉體的關系可能就像時空和物質的關系，能夠互相影響。電腦是由硬件和軟件結合組成的，未結合的硬件和軟件不完整。

? ?腦損傷會導致某些感覺受損但意識還在，說明意識并不一定依賴于這些感受。天生盲人、聾啞人可以擁有意識，說明意識應該是獨立于這些感受回路的。沒有視覺仍然可以有意識，但沒有意識則任何感受都沒有了。這些感受不是意識的核心，就像沒有鼠標鍵盤打印機甚至沒有顯示器、但電腦核心系統仍然在運行一樣，因此一些植物人或還有意識。沒有生活記憶，仍可以有意識。有些案例連只有5%正常大腦的人都可以有正常的記憶。腦畸形、腦水腫和因病去除近半個大腦的人人格仍幾乎不變、有正常智商。嚴重腦水腫幾乎沒有大腦的人仍能有人的正常意識，而大象和鯨魚那么大的大腦卻沒有人這般的意識水平。阿茲海默癥患者記不住自己是誰、住哪里。從外部看，病人都是有意識的，說明記憶不是意識的核心(有偽記憶)。重度癡呆會變得像嬰兒。意識似乎和智商沒什么直接關聯，比如未懂事小孩和傻的成人也是有意識的。意識會在麻醉、睡眠、缺氧、受到重大情緒刺激、物理撞擊等情況下關閉。

? ?腦部手術醒來的人有不同程度的認知和感官能力喪失，變得像一個幾歲的小孩或者很老的老人，視力、聽力、語言能力、運動能力、數學能力需要一段時間后才逐步恢復，他們獲得意識先于其它感官，這些現象也支持“意識不是簡單的感官功能的組合”的觀點。在腦部手術中有一種麻醉，能使得病人沒有觸覺、痛覺、也無法說話，但意識仍然清醒、能聽見醫生說話、扯線頭的聲音。腦損傷恢復意識后不會計算，似乎顯示數理邏輯是“未損傷前的大腦的功能”，而不是損傷后的。為何符合數理邏輯的物理大腦產生的意識卻能產生非數理邏輯的意識活動過程(比如非邏輯的“想象力”和非理性的信仰)呢?

嬰兒在能識別出自己的鏡像之前是否有意識? 答案似乎是有。那么老年癡呆癥晚期者是否有仍意識? 對比腦部損傷或腦部手術剛恢復意識時的“嬰兒模式”，似乎即使老年癡呆癥晚期也是有意識的。如果這樣，那么意識雖然和感覺以及認知能力有很大關系，但即使沒有認知能力和反應能力，意識仍然可能存在。一些腦部損傷或手術剛恢復意識短時期內，就像嬰兒一樣，幾乎沒有什么認知能力和反應能力，但病人清楚知道并且事后能回憶起那時自己醒了以及周圍發生的事情(比如護士讓他做簡單的數學計算但無法計算等)，那時也是有意識的，這個能覺知的核心和后天認知能力甚至個性性格沒多大關系。BF Skinner認為我們的行為是我們與環境互動的過程學習后形成的產物，鴿子等動物可以通過與環境互動并學習到新的個性行為，由此個性的外在表現--行為可以被環境塑造甚至強化成難以改變的習性。類似電腦在后天使用過程中被個性化，人格不是自我的核心。

動物可能有一定程度的意識，只是動物更深地依賴于潛意識本能，它們的大腦所建立起來的感知模型更大地限制了它們的意識的權限。不同物種的大腦模型和感官結構，歸根到底都是DNA信息寫好的，潛意識的源頭在DNA。動物也有松果體。

①連體嬰兒可以共享某一肢體，連腦姐妹可以共享部分視覺和味覺；②開顱手術醫生可以電擊控制病人肢體；③外部適當的磁場可以影響正常人的軀體活動，比如無法正常說話、面部表情扭曲、無法控制自己的手的動作、肢體不自主動作等。這幾個現象顯示在感覺和控制上被干擾的情況下，自主意識并未受到同樣嚴重的扭曲，自主意識仍清醒能覺知肢體或大腦被“不是自己意識的外部作用”影響了。

蜘蛛網意識理論認為意識隨著大腦功能的停止而消亡。該理論中意識是網絡集體概念，不是某個細胞或某個大腦部位的功能。其理由是清醒時微電擊大腦的電流才能大面積擴散，睡眠時只是一小部分區域發光。該理論認為只有在清醒的狀態下神經細胞才會像蜘蛛網一樣聯系起來，這種復雜連接才稱之為意識。該理論可計算“意識的量”(正比于神經細胞數量)，當神經細胞完全沒有聯系時，“意識的量”會歸0。有人將植物人的神經細胞數據套進該理論的數學式，計算結果顯示植物人應該仍有意識，然而從外面的看來、植物人的意識消失了。此外，嚴重腦水腫的人仍然有意識和基本智商。