1.Hibernate是全自動，而MyBatis是半自動。

Hibernate完全可以通過對象關系模型實現對數據庫的操作，擁有完整的JavaBean對象與數據庫的映射結構來自動生成sql。而MyBatis僅有基本的字段映射，對象數據以及對象實際關系依然需要通過手寫sql來實現和管理。

2.Hibernate數據庫移植性遠大于MyBatis。

Hibernate通過它強大的映射結構和hql語言，大大降低了對象與數據庫（Oracle、MySQL等）的耦合性，而MyBatis由于需要手寫sql，因此與數據庫的耦合性直接取決于程序員寫sql的方法，如果sql不具通用性而用了很多某數據庫騰訊的sql語句的話，移植性也會隨之降低很多，成本很高。

3.Hibernate擁有完整的日志系統，MyBatis則欠缺一些。

Hibernate日志系統非常健全，涉及廣泛，包括：sql記錄、關系異常、優化警告、緩存提示、臟數據警告等；而MyBatis則除了基本記錄功能外，功能薄弱很多。

4.MyBatis相比Hibernate需要關心很多細節。

Hibernate配置要比MyBatis復雜的多，學習成本也比MyBatis高。但也正因為MyBatis使用簡單，才導致它要比Hibernate關心很多技術細節。MyBatis由于不用考慮很多細節，開發模式上與傳統jdbc區別很小，因此很容易上手并開發項目，但忽略細節會導致項目前期bug較多，因而開發出相對穩定的軟件很慢，而開發出軟件卻很快。Hibernate則正好與之相反。但是如果使用Hibernate很熟練的話，實際上開發效率絲毫不差于甚至超過MyBatis。

5.sql直接優化上，MyBatis要比Hibernate方便很多。

由于MyBatis的sql都是寫在xml里，因此優化sql比Hibernate方便很。而Hibernate的sql很多都是自動生成的，無法直接維護sql；雖有hql，但功能還是不及sql強大，見到報表等變態需求時，hql也歇菜，也就是說hql是有局限的；Hibernate雖然也支持原生sql，但開發模式上卻與orm不同，需要轉換思維，因此使用上不上非常方便。總之寫sql的靈活度上Hibernate不及MyBatis。