我之前在博客園寫過一篇文章,是介紹生物學(xué)中基因組分析的plink的基本用法的,但是感覺博客園里有很多限制,不如在簡書上寫的暢快,所以打算把上面的東西遷移過來(不過由于我的文件在拷貝過程種,大量的文件誤刪,致使樣本文件丟失,實在令人心痛,不過,本篇文章即使沒有樣本也可以學(xué)習(xí)使用)。
? ? ? ? ? ? ?全基因組關(guān)聯(lián)分析是利用統(tǒng)計方法研究與性狀相關(guān)聯(lián)的基因。常用的軟件有plink,tassel,falmm等,
其中盡管R語言中提供了幾種常見的文件格式,個人感覺plink文件格式已經(jīng)成為了廣泛使用的基本格式。下面
是我在學(xué)習(xí)期間的plink學(xué)習(xí)總結(jié),請笑納: