文獻信息：
標題：Taxonomic Description and Genome Sequence of Christensenella intestinihominis sp. nov., a Novel Cholesterol-Lowering Bacterium Isolated From Human Gut
中文：從人類腸道中分離出的新型降膽固醇細菌Christensenella coccinihominis sp. nov.的分類描述和基因組序列
雜志：frontier in Microbiology
時間：2021.2.22 ONLINE
單位：深圳華大生命科學研究院

on pubmed：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33692769/

摘要：
從中國深圳一名30歲健康男性的糞便樣本中分離到一株革蘭氏染色陰性、非孢子形成、短、直桿、不活動、專性厭氧菌株AF73-05CM02T。在37℃厭氧條件下，在PYG瓊脂上培養4天后，菌落直徑約為0.2 mm，呈米黃色，呈圓形。菌株AF73-05CM02T的生長溫度為30 ~ 42℃，pH為6.0 ~ 8.5，最適生長溫度為37 ~ 42℃，pH為7.0。16S rRNA基因序列分析表明，菌株AF73-05CM02T屬于Christensenella屬，與Christensenella minuta DSM 22607T序列相似性最高(98.68%)。菌株AF73-05CM02T的主要脂肪酸為C10:0(7.5%)、iso-C11:0(5.6%)、C12:0(7.2%)、C14:0(46.6%)、iso-C15:0(7.4%)、C16:0(9.7%)和C18:1 ω9c(6.9%)。葡萄糖發酵的最終產物為乙酸、甲酸、丁酸和乳酸。該菌株對過氧化氫酶、吲哚和明膠水解均呈陰性反應。基于平均核苷酸同源性(ANI)的基因組相關性分析表明，AF73-05CM02T菌株與Christensenella屬其他種存在顯著差異，其ANI值小于82.89%，系統發育最接近。基因組DNA中G + C含量為52.07 mol%，與克里斯滕森氏菌不同。一些生理、生化和基因型的屬性區分小說相關物種的菌株,表明應變代表一種新的屬Christensenella的名字Christensenella intestinihominis sp. 11月提出與應變AF73-05CM02T (= CGMCC 1.5207 t = DSM 103477 t)應變類型。接下來我們對菌株AF73-05CM02T和Christensenella minuta DSM 22067T的降膽固醇功能進行了研究，發現這兩株菌株的降膽固醇能力分別為36.6和54.3%，胞外多糖含量分別為234和271 mg/L。

1 菌株AF73-05CM02T及系統發育相關種的BLAST基因相似性和ANI值(以百分比表示)

2 基于16S rRNA基因序列的最大似然系統進化樹分析菌株AF73-05CM02T與相關類群代表的系統進化關系

3 CGView服務器使用默認參數獲取Christensenella testinihominis sp. nov. AF73-05CM02T, Christensenella minuta DSM 22607T, Catabacter hongkonggensis HKU16T，“Christensenella massiliensis”marseile - p2438t，和“Christensenella timonensis”marseile - p2437t基因組圓形圖。

4 球蟲AF73-05CM02T基因組特征及與近緣種的比較

5 菌株AF73-05CM02T COG功能相關基因的分布

6 從菌株AF73-05CM02T和C. minuta DSM 22607T全基因組序列中鑒定出與生物合成通路相關的基因數量

7 AF73-05CM02T菌株與克里斯滕森氏菌帝斯曼22607T菌株之間的基因組共性

8 C. testinhominis AF73-05CM02T與最接近的參考菌株C. minta DSM 22607T表型特征比較

9 菌株AF73-05CM02T及其近緣種DSM 22607T的細胞脂肪酸組成

一篇優秀的文章上線了，股掌??