NG | 孟德爾隨機分析菌群&代謝物因果關系

文章
標題:Mendelian randomization analyses support causal relationships between blood metabolites and the gut microbiome
中文:孟德爾隨機化分析支持了血液代謝物和腸道菌群的因果關系
期刊:Nature Genetics
時間:2022.1.3
單位:BGI深圳

摘要
腸道微生物群與各種生理狀態有關,但關于因果關系的爭議仍未解決?。在此,我們對3432名具有全基因組、全宏基因組、人體計量學和血液代謝特征數據的中國個體進行了雙向孟德爾隨機化分析。我們確定了腸道微生物群和血液代謝物之間的58種因果關系,并復制了其中的43種。糞便Oscillibacter和Alistipes相對豐度的增加與甘油三酯濃度的降低有因果關系。相反,血液代謝物如谷氨酸似乎降低了糞便草酸桿菌,變形菌門的成員受到代謝物如5-甲基四氫葉酸、丙氨酸、谷氨酸和硒的影響。來自日本生物庫的兩樣本孟德爾隨機化方法部分證實了甘油三酯和尿酸的結果,也為已發表的癌癥和心血管疾病的糞便細菌標記物提供了因果支持。這項研究說明了人類遺傳信息的價值,以幫助優先考慮腸道微生物特征的機制和臨床研究。

研究設計

結果
1 糞便微生物與宿主遺傳變異相關

獨立遺傳變異對細菌特征變化的解釋度

2 血液中的代謝物與宿主遺傳變異有關


獨立遺傳變異對血液代謝物變化的解釋度

3 從觀察的相關到孟德爾隨機
腸道微生物和血液代謝物58對存在因果聯系

4 腸道微生物對血液中代謝物的影響
Oscillibacter和Alistipes菌屬與血液甘油三脂的因果關系

5 血液中代謝物對腸道微生物的影響

6 腸道微生物和疾病的因果關系
使用六種不同的two-sample MR方法

Proteobacteria和疾病
Escherichia coli和疾病

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Nat Genet | 孟德爾隨機方法助力腸道菌群與血液指標的因果關系發掘
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