融合基因和可變剪接

融合基因

融合基因的分析也是轉錄組下游的一個分析,通常發生在染色體重排的情況下,導致距離相隔較遠的的基因結合在一起,這種組合會造成基因失調和生成“嵌合體蛋白”,從而易引發表型改變。

融合基因的分析軟件有:


參考自犇牛科技課件

常用的有STAR-Fusion,因為STAR比對輸出的bam文件可以直接用來做融合基因分析。


可變剪接(Alternative splicing, AS)

可變剪接指 不同的剪切方式使得同一個基因可以產生多個不同的成熟mRNA, 最終產生不同的蛋白質。95%的基因都存在可變剪切現象。可變剪切導致了轉錄本和蛋白質結構與功能的多態性,是一種重要的轉錄調控機制。

可變剪接的方式:

常見的有4種:


可變剪接分析的軟件有:

?著作權歸作者所有,轉載或內容合作請聯系作者
平臺聲明:文章內容(如有圖片或視頻亦包括在內)由作者上傳并發布,文章內容僅代表作者本人觀點,簡書系信息發布平臺,僅提供信息存儲服務。

推薦閱讀更多精彩內容

  • 通過一個小任務來幫助理解轉錄組測序的點滴首先,設想手頭有一個物種的三個基因ABC,它們的長度分別是10bp、100...
    劉小澤閱讀 5,309評論 1 34
  • 知識的學習沒有一蹴而就,沒有捷近,扎實的學習是唯一的捷近。 一篇RNA-seq分析流程的綜述,全面而詳細!深度好文...
    dandanwu90閱讀 49,122評論 5 152
  • 小草無論是被大石壓頂 還是被路人踐踏 春雷號角響起 它都會頑強的向大地 ...
    菡萏_891c閱讀 338評論 0 0
  • 1. print ('a+b=',a+b) print ('a-b=',a-b) print ('a*b=',a*...
    飛奔的紅舞鞋閱讀 324評論 0 0
  • 本篇來自 **WizardDragon **的投稿,分享了他對于四大組件啟動時一些方法的調用順序的研究結果,并且深...
    堅持編程_lyz閱讀 529評論 0 2