TCGA是個大寶庫,有很多方便下載分析TCGA某一癌癥RNA表達數據的網站,部分能直接出圖(這些網站還有其他的功能,比如上傳分析自己的數據)。這里給大家匯總一下(持續更新中),歡迎留言分享:
1、TCGA官網GDC
https://portal.gdc.cancer.gov/
2、cbioportal
https://www.cbioportal.org/
4、GEPIA
http://gepia2.cancer-pku.cn/
5、firebrowse
http://firebrowse.org/
6、The human protein atlas
https://www.proteinatlas.org/
當然,能從下載數據到分析出圖一條龍的TCGA R包也不少,有時間再匯總