常用TCGA數據下載及分析網站

TCGA是個大寶庫,有很多方便下載分析TCGA某一癌癥RNA表達數據的網站,部分能直接出圖(這些網站還有其他的功能,比如上傳分析自己的數據)。這里給大家匯總一下(持續更新中),歡迎留言分享:

1、TCGA官網GDC
https://portal.gdc.cancer.gov/

2、cbioportal
https://www.cbioportal.org/

3、xena
[https://xenabrowser.net/datapages/?cohort=TCGA%20Pan-Cancer%20(PANCAN)&removeHub=https%3A%2F%2Fxena.treehouse.gi.ucsc.edu%3A443]


4、GEPIA
http://gepia2.cancer-pku.cn/

5、firebrowse
http://firebrowse.org/

6、The human protein atlas
https://www.proteinatlas.org/

當然,能從下載數據到分析出圖一條龍的TCGA R包也不少,有時間再匯總

最后編輯于
?著作權歸作者所有,轉載或內容合作請聯系作者
平臺聲明:文章內容(如有圖片或視頻亦包括在內)由作者上傳并發布,文章內容僅代表作者本人觀點,簡書系信息發布平臺,僅提供信息存儲服務。