關(guān)于WGCNA的分析,共有3期
教程,今天是的第三期。前面兩期是使用代碼進(jìn)行分析的,也是我們的平時(shí)最常用的分析方法,對(duì)我個(gè)人來(lái)說(shuō)也是最簡(jiǎn)潔的方法。(PS:對(duì)于使用代碼分析,個(gè)人有個(gè)人的看法。如果你看得懂代碼,那么是非常方便的;但是,一旦你遇到超出你能力范圍的代碼,就需要你獲得別人的幫助
)
[WGCNA分析教程二]((https://mp.weixin.qq.com/s/Ln9TP74nzWhtvt7obaMp1A)
我們的前面兩個(gè)教程是付費(fèi)
教程,對(duì)于這個(gè)價(jià)格是否值得,就是仁者見(jiàn)仁,智者見(jiàn)智
。
上面的教程,所有代碼都原封不動(dòng)的附上,只需改動(dòng)幾個(gè)參數(shù)就可以;如果,你連需要改那幾個(gè)參數(shù)都不知道,那么請(qǐng)看我每個(gè)教程的視頻解析;那么,仍然不知道,我們也沒(méi)辦法了
今天的教程是來(lái)自TBtools | 零基礎(chǔ)掌握WGCNA共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析 - 「WGCNAshiny by Warlock」,作者已經(jīng)提供了詳細(xì)的使用教程,也是非常方便的。直接按照作者的操作分析即可。你考慮的問(wèn)題,作者大佬都給你考慮到了?。?/strong>
具體請(qǐng)自己詳細(xì)看一下。
作者代碼存放位置:在GitHub中(https://github.com/ShawnWx2019/WGCNA-shinyApp)
自己使用作者教程安裝時(shí)遇到的問(wèn)題
我們?cè)赥Btools使用WGCNA shiny
插件,啟動(dòng)后會(huì)進(jìn)行安裝相關(guān)的包,但是也許我的環(huán)境問(wèn)題,一直安裝不上,出現(xiàn)報(bào)錯(cuò)的情況。
當(dāng)你遇到這樣的情況,我們最好的解決辦法就是直接使用作者的代碼在
Rstudio
中的運(yùn)行即可,運(yùn)行成功后直接跳出可視化操作框。運(yùn)行成功后的界面
那么后的操作就按作者的教程進(jìn)行即可TBtools | 零基礎(chǔ)掌握WGCNA共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析 - 「WGCNAshiny by Warlock」,但是,很多的操作還是需要自己來(lái)摸索。
前面WGNCA的教程:
小杜的生信筆記 ,主要發(fā)表或收錄生物信息學(xué)的教程,以及基于R的分析和可視化(包括數(shù)據(jù)分析,圖形繪制等);分享感興趣的文獻(xiàn)和學(xué)習(xí)資料!!